细胞因子暴露人巨噬细胞诱导疾病相关小胶质细胞转录特征

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE273912

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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   • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

包括脑驻留巨噬细胞（小胶质细胞）和外周巨噬细胞在内的髓系细胞，在多种病理状态中发挥关键作用，包括阿尔茨海默病（AD）等神经退行性疾病。它们通过获得多种转录状态来适应细胞外刺激。由于缺乏能够稳健地将其重编程为疾病相关表型的工具，目前对这些状态如何被调控的理解仍然有限。在本研究中，我们探究了包含白细胞介素-4（IL-4）、集落刺激因子1（CSF1/M-CSF）、白细胞介素34（IL-34）和转化生长因子β（TGFβ）的细胞因子混合物对人THP-1巨噬细胞的影响，以阐明其向疾病相关表型重编程的潜力及随后的功能变化。我们的结果表明，细胞因子混合物处理导致了显著的转录组变化，驱动人THP-1巨噬细胞进入一种类似于疾病相关小胶质细胞（DAM）和脂质相关巨噬细胞（LAM）的转录状态，二者统称为DLAM。

转录组分析揭示了与氧化磷酸化、溶酶体功能和脂质代谢相关的基因表达变化。单细胞RNA测序显示，多个细胞簇中DLAM样转录反应被激活。功能实验表明，巨噬细胞的运动性、吞噬作用、溶酶体活性以及代谢和能量特征均发生改变。我们的研究结果为细胞因子介导的巨噬细胞向疾病相关状态重编程提供了见解，凸显了其在神经退行性疾病中的作用及治疗开发潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。