GSE272590:APP通过溶酶体胞吐清除核废物发挥保护作用

研究聚焦阿尔茨海默病相关蛋白APP在基因毒性应激下通过溶酶体胞吐促进核来源废物清除的保护作用,涉及培养细胞与小鼠模型,并分析家族性AD相关APP突变及人AD脑组织

geo
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基因组分类GPL246769606
GSE272590: A protective role for APP in nuclear waste clearance via lysosomal exocytosis

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

GSE272590:APP通过溶酶体胞吐清除核废物发挥保护作用

A protective role for APP in nuclear waste clearance via lysosomal exocytosis

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE272590_series_matrix.txt.gz),主题为高通量测序表达谱分析,物种为人(9606),平台GPL24676。研究聚焦阿尔茨海默病相关蛋白APP在基因毒性应激下通过溶酶体胞吐促进核来源废物清除的保护作用,涉及培养细胞与小鼠模型,并分析家族性AD相关APP突变及人AD脑组织。数据可用于探索APP生理功能、核废物积累与炎症、细胞死亡的关系,以及AD病理机制相关的基因表达分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jul 18 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):淀粉样前体蛋白(APP)因其经蛋白水解加工生成淀粉样β肽而在阿尔茨海默病(AD)发病机制中的作用广为人知。然而,其生理功能仍未被完全理解。在此,我们揭示了全长APP在基因毒性应激下促进核来源碎片处置的保护作用。在培养细胞和体内小鼠模型中,APP缺失导致核废物积累、炎症增加和细胞死亡,而APP过表达则减轻这些效应。机制上,我们表明APP通过溶酶体胞吐支持核物质的细胞外释放。与家族性AD相关的APP突变体无法介导这一过程。一致地,人AD脑组织表现出异常的核形态、细胞质中核废物的积累以及每个神经元APP水平的降低。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE272590

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jun 11 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

淀粉样前体蛋白(APP)因其经蛋白水解加工作用生成淀粉样β肽、在阿尔茨海默病(AD)发病机制中的作用而广为人知。然而,其生理功能仍未被完全阐明。在此,我们揭示了全长APP在基因毒性应激下促进核源性碎片清除的保护性作用。在培养细胞和体内小鼠模型中,APP缺失导致核废物积累、炎症增加和细胞死亡,而APP过表达则减轻这些效应。在机制上,我们证明APP通过溶酶体胞吐作用支持核物质的细胞外释放。与家族性AD相关的APP突变体无法介导这一过程。与此一致,人类AD脑组织表现出异常的核形态、细胞质中核废物的积累以及每个神经元APP水平的降低。这些发现凸显了一种保守的细胞机制,APP借此参与核与细胞稳态,并提示核废物清除受损可能是神经退行性变一个尚未被充分认识的重要促成因素。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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