散发性早发型阿尔茨海默病三个脑区的单核多组学图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE272082

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数据说明

散发性早发性阿尔茨海默病（sEOAD）是阿尔茨海默病中一个重要但研究较少的亚型。在本研究中，我们从四名sEOAD患者和五名对照供者的死后前额叶皮层、内嗅皮层和海马中提取了超过70,000个细胞核，构建了单核多组学图谱。我们进行了全面分析，以描绘这些脑区中细胞类型特异性的转录组变化及相关的候选顺式调控元件（cCREs）。我们在多个脑区的胶质细胞和神经元中鉴定并优先排序了七个保守转录因子，包括星形胶质细胞中的RFX4和小胶质细胞中的IKZF1，它们参与sEOAD相关基因的调控。此外，我们研究了胶质细胞与神经元之间改变的细胞间信号传导，强调了它们对接收细胞基因表达的调控潜力。最后，我们报道了与sEOAD相关基因连锁的小胶质细胞cCREs中晚发性阿尔茨海默病风险位点的富集现象。

该图谱加深了我们对sEOAD中转录和染色质动态的理解，并为进一步的病理学研究提供了基础资源。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。