小鼠脑内过表达人突变APP转基因随暴露年龄诱导差异基因表达谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE271806

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

阿尔茨海默病（AD）是导致老年人痴呆症病例中约三分之二的最常见神经退行性疾病。尽管众多科学研究利用无脊椎动物和脊椎动物模型生物对AD的病理特征进行了深入探究，但其确切的内在机制仍知之甚少。细胞外β淀粉样蛋白（Aβ）肽的积累是AD的一个病理标志，并且根据流行的淀粉样蛋白假说，它被视为AD的起始点。在当前研究中，我们旨在探讨突变型APP转基因（APPSweInd）的表达是否会根据小鼠暴露年龄的不同而引发不同的神经学结果。为此，我们采用基于四环素的可诱导遗传系统，将APPSweInd转基因的表达靶向于从成年期开始的特定年龄区间，即6至18个月（=中年组）和12至24个月（=老年组）。

令人惊讶的是，突变型APP的过表达仅在老年小鼠大脑中降低了胆碱能网络相关基因的转录水平，而与炎症激活和胶质增生加剧相关的基因表达谱则在各年龄组间共有。因此，我们的数据支持这一观点：阿尔茨海默病病理可能依赖于胆碱能系统的破坏，而该破坏是由老年大脑对毒性Aβ聚集体的异常反应所触发的。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。