GSE271074：TREM2表达水平对小胶质细胞状态、代谢能力及TREM2激动剂疗效的关键作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE271074

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

髓系细胞触发受体2（TREM2）是小胶质细胞活性的核心调节因子，其序列变异是晚发性阿尔茨海默病（LOAD）的主要风险因素。利用报告基因模型，我们观察到TREM2随斑块邻近度增加而逐渐上调。根据报告基因表达对小胶质细胞进行分选分离，以测定氟脱氧葡萄糖（FDG）摄取及代谢组学、脂质组学和转录组学特征。FDG摄取与TREM2表达的逐渐增加相关。无论是否存在淀粉样病理，TREM2表达均改善了细胞氧化还原状态、能量代谢和胆固醇稳态。批量RNA测序分析鉴定出免疫代谢通路的主要变化。与氧化磷酸化或胆固醇稳态相关的基因在TREM2高表达簇中富集。最后，使用脑渗透性TREM2激动剂进行慢性治疗，确定了一个TREM2表达窗口，在此窗口内小胶质细胞最易产生保护性反应，这为当前将TREM2激动剂推向临床的努力提供了重要信息。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。