阿尔茨海默病早衰细胞单核转录组特征数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE264648

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

衰老与细胞衰老相关，是阿尔茨海默病（AD）的主要风险因素。我们利用成像质谱流式技术（IMC）和单核RNA（snRNA）测序（>200,000个细胞核），对非疾病对照（NDC）和阿尔茨海默病（AD）供者死后大脑中的过早细胞衰老进行了表征。我们发现，与NDC相比，AD中β-半乳糖苷酶（>4倍）和p16INK4A（高达2倍）免疫染色阳性的胶质细胞数量增加。与衰老相关基因的胶质表达增加与更大的β-淀粉样蛋白负荷相关。过早衰老的小胶质细胞下调了吞噬通路，提示β-淀粉样蛋白清除能力降低。基因集富集和伪时间轨迹描述了广泛的DNA双链断裂（DSB）、线粒体功能障碍和内质网应激，这些与β-淀粉样蛋白增加相关，导致小胶质细胞过早衰老。我们用独立的AD snRNA-seq数据集重复了这些观察结果。我们的结果描述了AD中衰老胶质细胞的负荷足够高，足以促进疾病进展。这些发现支持小胶质细胞是AD中衰老细胞清除治疗的主要靶点这一假说。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。