阿尔茨海默病小鼠模型淀粉样斑块微环境的小胶质细胞-星形胶质细胞交互空间转录组数据（Stereo-seq）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE263789

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
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3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在本研究中，我们利用高分辨率空间转录组学技术（CosMx和Stereo-seq），表征了AD小鼠模型中淀粉样斑块微环境的转录组改变、细胞组成及信号传导扰动。我们发现淀粉样斑块微环境的细胞组成具有广泛的异质性，其特征是随时间推移小胶质细胞积累增加。我们分析了胶质细胞暴露于斑块时所发生的变化，并得出结论：小胶质细胞对斑块的反应在不同脑区之间是一致的，而星形胶质细胞的反应则更具异质性。反过来，随着斑块微环境中小胶质细胞密度的增加，星形胶质细胞获得更具神经毒性的表型，并在诱导海马神经元中GABA能信号传导、减少谷氨酸能信号传导方面发挥关键作用。综上所述，我们表明斑块病理周围的星形胶质细胞信号传导随着小胶质细胞密度的增加而受到破坏，进而导致海马神经元中突触信号传导的失衡。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。