Inpp5d缺失对胶质细胞转录组具有疾病相关且性别特异的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE254999

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

引言：INPP5D与阿尔茨海默病风险存在遗传关联。Inpp5d缺失会改变淀粉样变性模型中的淀粉样病理。Inpp5d主要在小胶质细胞中表达，但其在大脑中的功能尚不清楚。方法：我们进行了单细胞RNA测序，以研究Inpp5d缺失对野生型小鼠大脑转录组的影响。结果：Inpp5d缺失对大脑转录组具有性别特异性影响。受影响的基因富集于多种神经退行性术语。网络分析揭示了雌性小鼠中以Inpp5d为中心的一个基因共表达模块。Inpp5d缺失改变了细胞类型之间PTN、PSAP和VEGFA信号传导概率。讨论：我们的数据表明，Inpp5d的正常功能与神经退行性变相关机制交织在一起。我们报告了无病理情况下Inpp5d缺失的影响，并表明这对基因表达具有显著影响。我们的研究为神经退行性变研究人员提供了重要参考，使得能够将疾病中由Inpp5d介导的疾病特异性变化与Inpp5d缺失的基线效应区分开来。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。