Tau过表达人SH-SY5Y细胞系RNA测序揭示Tau改变全局基因表达与染色质结构

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE239956

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

阿尔茨海默病和tau蛋白病是以神经元稳态改变和Tau蛋白聚集为特征的神经退行性疾病。Tau通常被认为是一种参与细胞骨架稳定和运输的蛋白，其失稳会导致神经元功能障碍和死亡。尽管对Tau的经典作用已有认识，近年来研究发现Tau在多种神经元功能中发挥关键作用。我们此前报道，Tau失稳和核内异位会改变介导早期神经元损伤的谷氨酸能基因的表达。本文提出，Tau能够深刻影响神经元转录组，其可用性与发育中的阿尔茨海默病中期阶段所发生的基因表达改变相关。此外，我们鉴定出表观遗传通路在阿尔茨海默病进展过程中受Tau的强烈影响。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。