TaqTth-hpRNA紧凑型RNA靶向工具特异性沉默致病mRNA

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE236392

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

致病性等位基因沉默是治疗遗传性遗传病的一种有前景的方法。然而，现有RNA敲低策略特异性的担忧限制了其体内应用。本文提供了一种由小型嵌合蛋白（TaqTth）和发夹RNA探针（hpRNA）组成的TaqTth-hpRNA系统。TaqTth-hpRNA对靶mRNA表现出高特异性敲低，侧翼序列基序需求极低，且细胞活力损伤较小，随后被应用于阿尔茨海默病中突变型APPswe mRNA的沉默而不改变野生型APP mRNA。值得注意的是，由于TaqTth体积紧凑，可将TaqTth与人载脂蛋白E2（APOE2）过表达编码于单一AAV载体中联合使用，并在小鼠模型中显示出更强的病理抑制效果。总之，我们为一种具有高选择性、极低侧翼序列基序需求、较小细胞活力损伤且可能成为治疗应用替代方案的小型RNA靶向工具提供了基础。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。