多西环素对肠道微生物组与神经炎症的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE236242

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

摘要：许多神经系统疾病的小鼠模型使用四环素反式激活因子（tTA）系统，通过口服广谱抗生素多西环素来控制转基因表达。用于转基因控制的抗生素治疗可能产生不良的全身性效应，包括通过改变肠道微生物组而影响大脑免疫反应的潜在可能。近期研究表明，在基于淀粉样前体蛋白（APP）受控过表达的阿尔茨海默病转基因小鼠模型中，使用抗生素混合物扰动肠道微生物组可抑制小胶质细胞对脑淀粉样变性的反应性。在此，我们在tTA调控的阿尔茨海默病淀粉样变性模型中，评估了长期低剂量多西环素对肠道微生物组多样性及全身LPS刺激后神经免疫反应的影响。我们发现，多西环素降低了APP转基因小鼠和野生型小鼠的微生物组多样性，且这些变化在停药后长期持续存在。尽管微生物组组成发生了上述变化，但多西环素治疗对大脑转录特征的影响极小，无论是在基线状态还是在急性LPS刺激后。

我们的研究结果表明，与用于微生物组操控的抗生素混合物剂量相比，用于转基因控制的dox剂量对中枢神经炎症反应的影响可能较小。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。