阿尔茨海默病动物模型中的miR-34a缺陷数据集

数据集可用于研究miR-34a在阿尔茨海默病动物模型中的作用,支持表达谱差异分析与预测建模(来源 NCBI)。源站首次发布:Jun 21 202

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基因组预测GPL2845710090
GSE235489: miR-34a deficiency in an animal model of Alzheimer's disease

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

阿尔茨海默病动物模型中的miR-34a缺陷数据集

GSE235489 是一个围绕阿尔茨海默病动物模型构建的基因表达数据集,主题为 miR-34a 缺失。该数据集来源于 NCBI,归入神经系统疾病 / 阿尔茨海默病分类,旨在支持研究者考察 miR-34a 在阿尔茨海默病发生发展中的作用。数据集以高通量测序进行表达谱分析,包含 1 个数据文件,样例文件为 GSE235489_series_matrix.txt.gz,采用 GZIP 压缩格式。整体而言,该数据集适合用于阿尔茨海默病相关表达谱的差异分析与预测建模,为探索 miR-34a 在疾病动物模型中的功能提供数据基础。

【数据集背景】

该数据集对应的研究聚焦于 miR-34a 在阿尔茨海默病中的作用。为开展相关研究,研究者创建了 miR-34a 缺失的阿尔茨海默病动物模型,并在此基础上进行表达谱分析。数据集标题直接点明“miR-34a deficiency in an animal model of Alzheimer's disease”,说明其核心科学问题围绕 miR-34a 缺失与阿尔茨海默病动物模型之间的关联展开。数据集被归入神经系统疾病 / 阿尔茨海默病方向,主题标签包含 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL28457 和 10090,表明其采用高通量测序技术获取表达谱数据,并涉及相应的平台与物种注释信息。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE235489_series_matrix.txt.gz,文件以 GZIP 压缩包形式提供。该文件属于系列矩阵文件,通常用于承载样本层面的表达谱汇总信息。数据集的主题标签表明其数据类型为高通量测序表达谱分析,涉及平台编号 GPL28457 以及物种编号 10090。除上述文件与标签信息外,源站未提供更细化的样本数量、分组设计、测序深度或表达矩阵字段说明。

【采集与来源】

数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,作者为 Ken-ichiro,Fukuchi,发布时间为 Jun 21 202。源站描述指出,为研究 miR-34a 在阿尔茨海默病中的作用,研究者创建了 miR-34a 缺失的阿尔茨海默病动物模型。该描述构成了数据集采集背景的核心说明。数据集的分类归属为神经系统疾病 / 阿尔茨海默病,主题标签进一步标明其表达谱分析采用高通量测序方式。关于样本采集的具体流程、动物模型构建细节、测序平台操作步骤等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于研究 miR-34a 在阿尔茨海默病动物模型中的作用,支持表达谱差异分析与预测建模。具体而言,研究者可基于该表达谱数据比较不同条件下的基因表达变化,探索与 miR-34a 缺失相关的表达模式,并可将数据用于构建或验证预测模型。由于数据集聚焦于阿尔茨海默病动物模型,其适用场景主要围绕神经疾病相关的表达谱研究。关于其他潜在应用方向,源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时,可下载数据文件 GSE235489_series_matrix.txt.gz,并按文件格式以 GZIP 压缩包方式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因字段理解偏差或编码问题导致后续分析错误。该文件为系列矩阵文件,读取后可用于表达谱层面的分析。关于具体的分析流程、标准化方法或软件工具,源站未提供。

【质量与限制】

数据集仅包含 1 个文件,文件样例为 GSE235489_series_matrix.txt.gz,采用 GZIP 压缩格式。源站未提供关于数据质量评估、缺失值情况、批次效应或技术重复的说明。由于数据集围绕 miR-34a 缺失的阿尔茨海默病动物模型构建,其结论外推到其他物种或其他疾病模型时需谨慎。关于样本量、测序深度、数据完整性等质量相关指标,源站未提供。

【引用与许可】

数据集作者为 Ken-ichiro,Fukuchi,发布时间为 Jun 21 202。数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov。关于具体的引用格式、许可条款或使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE235489

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为探究miR-34a在阿尔茨海默病中的作用,我们构建了miR-34a缺失的阿尔茨海默病动物模型。

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