阿尔茨海默病风险相关Abi3基因位点缺失导致小鼠肥胖和全身代谢紊乱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE212299

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在人类ABI3基因中发现了一种罕见的编码变异，该变异与阿尔茨海默病（AD）风险增加相关。在此发现之后，我们最近证明，在5xFAD淀粉样变性转基因小鼠模型中，Abi3基因座的缺失显著加剧了AD神经病理。在一项关于Abi3缺失对小鼠功能影响的相关研究中，我们意外发现了Abi3缺失对这些5xFAD小鼠非转基因同窝仔鼠的影响。在这些小鼠中，我们发现Abi3基因座的缺失导致了肥胖表型。因此，我们对这一偶然发现进行了研究。在本报告中，我们证明缺乏Abi3的小鼠体重和体脂显著增加。此外，我们确定这些缺乏Abi3的小鼠能量消耗减少。另外，我们发现Abi3基因座的缺失改变了基因表达，尤其是在下丘脑内的免疫通路中。

随后对中枢神经系统（CNS）的免疫组织学分析显示，在缺乏Abi3的小鼠中，小胶质细胞的数量和面积特异性地在下丘脑内侧基底部减少。总而言之，这项研究确立了Abi3基因座的功能重要性，尤其是在CNS中，在系统代谢调节和维持健康体重方面。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。