APOE ε4 人类小胶质细胞与星形胶质细胞胆固醇及基质体通路失调数据集 [populationAPOE]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE190187

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

载脂蛋白E4（APOE4）是阿尔茨海默病（AD）最强的遗传风险因素，但其对人脑细胞功能的影响仍不清楚。在此，我们研究了APOE4对来源于人群和同基因型人类诱导多能干细胞模型、死后脑组织以及APOE靶向替换小鼠的脑细胞类型的影响。人群和同基因型模型揭示，APOE4局部单倍型而非单一风险等位基因单独促成风险。全局转录组分析揭示了星形胶质细胞和小胶质细胞中人类特异性的、APOE4驱动的脂质代谢失调。APOE4导致从头胆固醇合成升高，尽管星形胶质细胞中胆固醇的溶酶体隔离导致细胞内胆固醇积累。转录组分析揭示了与星形胶质细胞中趋化性、胶质激活和脂质生物合成上调相关的Matrisome失调，与神经元共培养再现了人脑中改变的星形胶质细胞matrisome信号传导。因此，APOE4引发胶质细胞特异性的细胞及非细胞自主性失调，这可能促成AD风险增加。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。