hiPSC来源星形胶质细胞的CROP-seq（scRNA-Seq）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE182308

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

针对中枢神经系统损伤或疾病，星形胶质细胞会变为反应性，呈现出功能改变的、依赖于具体情境的状态。某些炎症性刺激可诱导反应性星形胶质细胞状态，使其丧失稳态功能并获得神经毒性，且可能促进神经炎症和神经退行性疾病。然而，控制这些状态的细胞通路尚未被完全理解。在此，我们将单细胞转录组学与人类iPSC来源星形胶质细胞中的CRISPRi筛选相结合，以系统性地探究炎症反应性。我们发现，经典NF-kB激活下游的自分泌-旁分泌IL-6和干扰素信号分别驱动了两种不同的炎症反应性状态，分别依赖于STAT3和IRF1。此外，这些状态与在其他实验情境（包括体内）中观察到的状态相对应，并且其标志物在阿尔茨海默病和缺血缺氧性脑病的人类大脑中上调。这些结果以及我们建立的平台有潜力指导开发能够选择性调节炎症性星形胶质细胞反应性不同方面的治疗手段。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。