阿尔茨海默病中增殖小胶质细胞的转录与功能改变

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE173453

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

小胶质细胞的增殖是一个生理过程，在包括阿尔茨海默病在内的多种神经退行性疾病中加速。这种与神经退行性变相关的小胶质细胞增殖对功能和疾病进展的影响仍不清楚。我们假设，小胶质细胞在神经退行性环境中增殖会产生转录和功能发生改变的亚群，这些亚群可能促进从急性向慢性神经炎症的转变。在此，我们证明增殖导致细胞功能的深刻改变，提供证据表明新增殖的小胶质细胞在体内表现出受损的β-淀粉样蛋白清除能力。通过对APP/PS1小鼠增殖小胶质细胞的分选及随后的转录组分析，我们定义了独特的增殖相关转录组特征，这些特征随年龄和β-淀粉样蛋白积累而变化，并以免疫系统相关通路的富集为特征。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。