体外重建人血脑屏障揭示APOE4在周细胞中的致病机制

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE125869

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

大多数阿尔茨海默病患者以及20%–40%的非痴呆老年人群，其脑血管周围存在淀粉样蛋白沉积，这一状况被称为脑淀粉样血管病（CAA）。CAA损害血脑屏障（BBB）的功能，导致缺血、出血以及认知功能障碍加速。APOE4等位基因是已知最强的CAA和散发性AD遗传风险因素，然而这种易感性的致病机制尚不清楚。在此，我们通过将BBB的三种细胞成分——内皮细胞、周细胞和星形胶质细胞——在3D支架中共培养，在体外重建人BBB，以构建一个可操作的模型，重现BBB的关键解剖和生理特性。与体内BBB类似，我们发现淀粉样蛋白会在我们的体外BBB（iBBB）上积累，且APOE4纯合和杂合iBBB均表现出显著多于APOE3/3 iBBB的淀粉样蛋白积累。组合实验揭示，周细胞在CAA的发生中具有因果作用。我们发现，APOE表达在APOE4周细胞中显著上调，而在星形胶质细胞或内皮细胞中则不然。

转录谱分析显示，钙调神经磷酸酶/NFAT信号在APOE4周细胞中失调。药理学抑制钙调神经磷酸酶导致APOE下调，随后减少了iBBB上的淀粉样蛋白沉积。这些结果表明周细胞在脑淀粉样蛋白沉积中具有意想不到的作用，并主张将抑制钙调神经磷酸酶/NFAT信号作为减轻APOE4易感性至CAA及潜在AD的治疗策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。