GSE117646：小胶质细胞翻译谱揭示衰老、淀粉样蛋白和tau汇聚的APOE通路

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE117646

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

阿尔茨海默病（AD）是一种与年龄相关的神经退行性疾病，其特征为淀粉样变性、tau蛋白病变以及小胶质细胞（脑内驻留的固有免疫细胞）的激活。我们展示了一种RiboTag翻译谱分析方法，能够规避因细胞富集/细胞分选而导致的偏差。在我们近期题为“小胶质细胞翻译谱分析揭示衰老、淀粉样变性和tau蛋白病变汇聚于APOE通路”的研究中，我们利用该方法在淀粉样变性、tau蛋白病变和衰老模型中获取的数据，揭示了一组共同的改变，并鉴定出一个以APOE为核心驱动、在所有条件下均汇聚于CCL3和CCL4的网络。值得注意的是，对衰老雌性数据集的分析显示，该APOE网络中许多共享转录本显著加剧，揭示了雌性AD易感性增加的潜在机制。该研究对小胶质细胞转录组学方法具有广泛意义，并为与衰老和AD不同病理方面相关的小胶质细胞通路提供了新见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。