阿尔茨海默病脑与血液DNA（羟）甲基化组：OXT甲基化作为临床前标志物

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE109887

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究探讨了DNA甲基化组和羟甲基化组，以及未修饰的胞嘧啶与阿尔茨海默病（AD）的关系。我们在中颞回中发现了AD患者与年龄匹配对照组之间的表观遗传差异，这些差异位于与OXT、ACSL1、RHBDF2、C3和MIR9-3HG等基因相关的基因组区域。有趣的是，我们发现，在年长且未患痴呆的个体血液中，OXT甲基化也与转化为AD痴呆相关。当前的GEO提交涉及本研究的颞中回Illumina HumanHT-12 V4.0表达数据集，该数据集用于探究所检测到的表观遗传变化与基因表达之间的相关性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。