阿尔茨海默病新皮层基因表达改变的全基因组谱（基因水平）

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-37263

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们研究了一个特征明确的阿尔茨海默病（AD）患者队列的颞叶皮层全基因组基因改变，使用了Affymetrix外显子芯片。AD患者和对照者最初是作为OPTIMA（牛津记忆与衰老调查项目）的研究对象招募的。受试者接受了年度临床和神经心理学评估，包括剑桥认知检查（CAMCOG）。在死亡且近亲同意尸检的受试者中，从AD受试者新鲜冷冻大脑的BA22区切取了1 cm³的灰质块。对照老年受试者的组织也被收集，这些受试者在生前接受了纵向随访，且在死亡前最后一次评估时CAMCOG评分>80。对8例对照和8例AD样本进行了Affymetrix外显子芯片检测。每次杂交运行中处理的样本在AD与对照、性别和死后间隔时间（PMI）方面尽可能匹配。本次提交包含基因水平分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。