阿尔茨海默病与帕金森病中内体-溶酶体蛋白及泛素脑脊液浓度数据集

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/panorama/PXD013451

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数据说明

阿尔茨海默病（AD）和帕金森病（PD）是以脑内蛋白质聚集体积累为特征的神经退行性疾病。AD是痴呆最常见的病因，表现为记忆和认知功能损害。PD由多巴胺能神经元丢失引起，导致运动症状如运动迟缓、静止性震颤和/或肌强直。在AD和PD中，神经病理学研究和遗传关联研究均表明蛋白质稳态功能障碍是其病理特征。蛋白质稳态由自噬和內体-溶酶体系统以及泛素-蛋白酶体系统维持。我们旨在通过靶向参与蛋白质稳态的蛋白质来研究新的潜在脑脊液（CSF）生物标志物。CSF中蛋白质浓度的可测量变化可能反映神经退行性疾病中蛋白质稳态的改变。我们通过结合固相萃取（SPE）与平行反应监测质谱（PRM MS），从18种蛋白质中鉴定并靶向了50种肽段。

这些蛋白质的脑脊液浓度在四项横断面研究中进行了测定，研究对象包括AD患者（N=61）、PD患者（N=21）、前驱期AD患者（N=10）、稳定型轻度认知障碍患者（稳定型MCI；N=15）以及对照组（N=68）。两项初步研究（研究1和研究2）显示，与生化特征正常的受试者相比，具有AD病理生化证据的受试者中多种蛋白质浓度升高。一项纳入临床特征受试者的研究（研究3）则显示，与 前驱期AD相比，PD患者脑脊液中多种蛋白质浓度降低。随后对随访队列（研究4）进行了分析，该队列同样纳入临床特征受试者。再次发现，与对照组和AD相比，PD患者脑脊液浓度降低。在各研究中鉴定出蛋白质浓度存在显著差异的蛋白质包括AP2B1、C9、CTSB、CTSF、GM2A、LAMP1、LAMP2、TCN2和泛素。被反复鉴定出具有显著d

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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