E-PROT-32:阿尔茨海默病早期和晚期受tau病理影响脑区的蛋白质组特征
E-PROT-32 是收录于 ebi.ac.uk 的 Expression Atlas 实验,主题标记为 Baseline,物种为 Homo sapiens,研究对象是阿尔茨海默病早期和晚期中受 tau 病理影响脑区的蛋白质组特征

基本信息
资源简介
E-PROT-32:阿尔茨海默病早期和晚期受tau病理影响脑区的蛋白质组特征
E-PROT-32 是收录于 ebi.ac.uk 的 Expression Atlas 实验,主题标记为 Baseline,物种为 Homo sapiens,研究对象是阿尔茨海默病早期和晚期中受 tau 病理影响脑区的蛋白质组特征。
【数据集背景】
该数据集在站点分类中归入神经系统疾病 / 阿尔茨海默病。其完整英文名称为 E-PROT-32: Proteomic signatures of brain regions affected by tau pathology in early and late stages of Alzheimer's disease。来源站说明其为 Expression Atlas experiment (Baseline),物种为 Homo sapiens,并直接指向“受 tau 病理影响的脑区在阿尔茨海默病早期和晚期阶段的蛋白质组特征”。这些信息表明,数据集的核心主题围绕阿尔茨海默病、tau 病理、脑区以及疾病早晚期阶段展开。至于研究动机、疾病分期定义、tau 病理判定方式、所涉及的具体脑区、队列来源和实验假设,源站未提供。
【数据内容】
来源站说明该条目是一个 Expression Atlas 实验,并标记为 Baseline,物种为 Homo sapiens。标题层面的信息指向脑区蛋白质组特征,并涉及阿尔茨海默病早期和晚期受 tau 病理影响的脑区。然而,该数据集实际包含多少样本、覆盖哪些脑区、鉴定或定量了多少蛋白质、是否包含差异表达结果、是否有临床分组、是否有原始数据与处理后数据、数据文件格式和版本信息等,源站未提供。因此,无法从现有信息判断其数据规模、组织层级和可复用程度。
【采集与来源】
来源站为 ebi.ac.uk。该实验出现在 Expression Atlas 中,并标注为 Baseline,物种为 Homo sapiens。除此之外,样本采集地点、伦理审批、供体信息、分组标准、蛋白质组学平台、质谱方法、定量策略、数据处理流程、分析软件和版本等,源站未提供。
【适用场景】
源站未提供该数据集的具体适用场景。可确认的信息仅包括:其分类属于神经系统疾病 / 阿尔茨海默病,主题标记为 Baseline,物种为 Homo sapiens,并与阿尔茨海默病早期和晚期受 tau 病理影响脑区的蛋白质组特征有关。除这些主题信息外,是否适合差异比较、通路分析、生物标志物筛选或验证研究等,源站未提供。
【使用方法】
可经由 ebi.ac.uk 访问 Expression Atlas,并按实验名称或主题查找该条目。对于如何浏览、筛选、下载、调用 API、获取原始文件、理解数据处理步骤以及进行下游分析,源站未提供说明。实际使用时需以来源站页面所提供的信息为准。
【质量与限制】
源站未提供质量控制指标、样本量、重复数、统计显著性、多重检验校正、批次效应处理、数据完整性、版本更新记录或已知局限。可确认的是主题标记为 Baseline,物种为 Homo sapiens,归入神经系统疾病 / 阿尔茨海默病,并涉及 tau 病理早晚期脑区蛋白质组特征。由于现有信息有限,不能对该数据集的质量、偏倚、覆盖范围或结论强度作出判断。
【引用与许可】
源站未提供许可条款、使用限制、引用格式、DOI、访问权限或需联系的机构。若需引用,可使用该数据集英文名称:E-PROT-32: Proteomic signatures of brain regions affected by tau pathology in early and late stages of Alzheimer's disease。更完整的引用要求、作者列表和许可信息,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-PROT-32
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Expression Atlas 实验(基线)。物种:Homo sapiens。阿尔茨海默病早期和晚期受 tau 病理影响的脑区的蛋白质组特征。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




