E-PROT-32:阿尔茨海默病早期和晚期受tau病理影响脑区的蛋白质组特征

E-PROT-32 是收录于 ebi.ac.uk 的 Expression Atlas 实验,主题标记为 Baseline,物种为 Homo sapiens,研究对象是阿尔茨海默病早期和晚期中受 tau 病理影响脑区的蛋白质组特征

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蛋白质分类Baseline
E-PROT-32: Proteomic signatures of brain regions affected by tau pathology in early and late stages of Alzheimer's disease

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

E-PROT-32:阿尔茨海默病早期和晚期受tau病理影响脑区的蛋白质组特征

E-PROT-32 是收录于 ebi.ac.uk 的 Expression Atlas 实验,主题标记为 Baseline,物种为 Homo sapiens,研究对象是阿尔茨海默病早期和晚期中受 tau 病理影响脑区的蛋白质组特征。

【数据集背景】

该数据集在站点分类中归入神经系统疾病 / 阿尔茨海默病。其完整英文名称为 E-PROT-32: Proteomic signatures of brain regions affected by tau pathology in early and late stages of Alzheimer's disease。来源站说明其为 Expression Atlas experiment (Baseline),物种为 Homo sapiens,并直接指向“受 tau 病理影响的脑区在阿尔茨海默病早期和晚期阶段的蛋白质组特征”。这些信息表明,数据集的核心主题围绕阿尔茨海默病、tau 病理、脑区以及疾病早晚期阶段展开。至于研究动机、疾病分期定义、tau 病理判定方式、所涉及的具体脑区、队列来源和实验假设,源站未提供。

【数据内容】

来源站说明该条目是一个 Expression Atlas 实验,并标记为 Baseline,物种为 Homo sapiens。标题层面的信息指向脑区蛋白质组特征,并涉及阿尔茨海默病早期和晚期受 tau 病理影响的脑区。然而,该数据集实际包含多少样本、覆盖哪些脑区、鉴定或定量了多少蛋白质、是否包含差异表达结果、是否有临床分组、是否有原始数据与处理后数据、数据文件格式和版本信息等,源站未提供。因此,无法从现有信息判断其数据规模、组织层级和可复用程度。

【采集与来源】

来源站为 ebi.ac.uk。该实验出现在 Expression Atlas 中,并标注为 Baseline,物种为 Homo sapiens。除此之外,样本采集地点、伦理审批、供体信息、分组标准、蛋白质组学平台、质谱方法、定量策略、数据处理流程、分析软件和版本等,源站未提供。

【适用场景】

源站未提供该数据集的具体适用场景。可确认的信息仅包括:其分类属于神经系统疾病 / 阿尔茨海默病,主题标记为 Baseline,物种为 Homo sapiens,并与阿尔茨海默病早期和晚期受 tau 病理影响脑区的蛋白质组特征有关。除这些主题信息外,是否适合差异比较、通路分析、生物标志物筛选或验证研究等,源站未提供。

【使用方法】

可经由 ebi.ac.uk 访问 Expression Atlas,并按实验名称或主题查找该条目。对于如何浏览、筛选、下载、调用 API、获取原始文件、理解数据处理步骤以及进行下游分析,源站未提供说明。实际使用时需以来源站页面所提供的信息为准。

【质量与限制】

源站未提供质量控制指标、样本量、重复数、统计显著性、多重检验校正、批次效应处理、数据完整性、版本更新记录或已知局限。可确认的是主题标记为 Baseline,物种为 Homo sapiens,归入神经系统疾病 / 阿尔茨海默病,并涉及 tau 病理早晚期脑区蛋白质组特征。由于现有信息有限,不能对该数据集的质量、偏倚、覆盖范围或结论强度作出判断。

【引用与许可】

源站未提供许可条款、使用限制、引用格式、DOI、访问权限或需联系的机构。若需引用,可使用该数据集英文名称:E-PROT-32: Proteomic signatures of brain regions affected by tau pathology in early and late stages of Alzheimer's disease。更完整的引用要求、作者列表和许可信息,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-PROT-32

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas 实验(基线)。物种:Homo sapiens。阿尔茨海默病早期和晚期受 tau 病理影响的脑区的蛋白质组特征。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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