E-PROT-21:原发性前列腺癌及相应非恶性组织的蛋白质组

E-PROT-21 是一个以人类为研究对象的前列腺癌蛋白质组数据集,主题为原发性前列腺癌及其对应非恶性组织的蛋白质组,属于表达图谱(Expression Atlas)中的基线(Baseline)实验

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蛋白质分类Baseline
E-PROT-21: The Proteome of Primary Prostate Cancer and Corresponding Nonmalignant Tissue

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

E-PROT-21:原发性前列腺癌及相应非恶性组织的蛋白质组

E-PROT-21 是一个以人类为研究对象的前列腺癌蛋白质组数据集,主题为原发性前列腺癌及其对应非恶性组织的蛋白质组,属于表达图谱(Expression Atlas)中的基线(Baseline)实验。

【数据集背景】

该数据集的英文全称为 E-PROT-21: The Proteome of Primary Prostate Cancer and Corresponding Nonmalignant Tissue。从这一名称可以看出,其关注对象是原发性前列腺癌组织,以及与这些肿瘤组织相对应的非恶性组织,二者在同一数据集框架内被并列呈现。数据集涉及的物种为人类(Homo sapiens)。它在表达图谱(Expression Atlas)体系中被登记为一项基线实验,并带有 Baseline 这一主题标签;在面向使用者的分类中,它被归入肿瘤/前列腺癌类别。至于该项研究为何立项、由哪一研究团队主导、样本来自哪一地区或哪一临床队列、以及研究希望回答的具体科学问题,源站未提供。

【数据内容】

依据现有描述,数据集的内容围绕原发性前列腺癌与对应非恶性组织中的蛋白质组展开。它被标注为基线类型,说明其呈现的是上述组织在相应条件下蛋白质表达或丰度的基线层面信息,而非某种扰动或处理后的对比结果。至于数据集中包含多少例样本、覆盖多少种蛋白质、采用何种定量策略、是否附带临床分期或其他病理信息、是否区分癌区与癌旁区的取材位置,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,即欧洲生物信息研究所的站点。在源站上,它的描述为一项表达图谱实验(Baseline),物种为人类,内容为原发性前列腺癌及对应非恶性组织的蛋白质组。数据集被归入肿瘤/前列腺癌这一类别,并带有 Baseline 主题标签。除此之外,样本采集流程、所使用的实验平台与仪器、样本制备方法、原始数据的存放位置以及是否可获取原始谱图文件等信息,源站未提供。

【适用场景】

从数据集的主题来看,它涉及前列腺癌组织与其对应非恶性组织中的蛋白质组信息,因此与前列腺癌相关的基础研究、组织间分子特征比较等方向存在主题上的关联。不过,关于该数据集具体适用于哪些分析任务、是否可用于标志物筛选、通路分析或跨数据集整合,源站未提供,使用前需自行查阅源站以获得进一步说明。

【使用方法】

关于如何下载该数据集、如何检索其中的蛋白质或样本条目、是否提供可视化界面、是否有配套的分析工具或 API、以及需要满足哪些前置条件才能访问,源站未提供。

【质量与限制】

关于该数据集的样本量是否充足、定量结果的重复性、数据完整性、批次效应、覆盖深度等方面的评估结论,以及使用时应留意的局限,源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集应如何引用、对应的文献出处、许可条款与再使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-PROT-21

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas 实验(基线)。物种:Homo sapiens。原发性前列腺癌及相应非恶性组织的蛋白质组

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