数据和代码:阿尔茨海默病模型中海马CA1区早期空间与情境编码缺陷先于行为衰退
该数据集来自 search.dataone.org,包含一项关于阿尔茨海默病早期海马表征变化研究的数据与代码。研究采用真实世界头部固定空间交替任务结合在体双光子成像,考察 5xFAD 小鼠海马 CA1 区表征

基本信息
资源简介
数据和代码:阿尔茨海默病模型中海马CA1区早期空间与情境编码缺陷先于行为衰退
Data and code from: Early spatial and contextual coding deficits in hippocampal CA1 precede performance decline in an Alzheimerâs disease model
该数据集来自 search.dataone.org,包含一项关于阿尔茨海默病早期海马表征变化研究的数据与代码。研究采用真实世界头部固定空间交替任务结合在体双光子成像,考察 5xFAD 小鼠海马 CA1 区表征。7-9 月龄 5xFAD 小鼠任务学习显著受损,而 2-4 月龄小鼠表现正常,从而可在行为衰退前评估海马编码。该阶段 CA1 神经元全局空间编码完整,但任务相关位置细胞表征受损,轨迹依赖编码揭示的情境表征在群体和单细胞水平均减弱,并伴随从回溯性向前瞻性编码的明显转变(来源 DataONE)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):阿尔茨海默病(AD)以进行性记忆衰退为特征,但海马表征在 AD 早期阶段如何变化仍很大程度上未知。在本研究中,我们利用真实世界头部固定空间交替任务结合在体双光子成像,研究 5xFAD 小鼠的海马 CA1 区表征。虽然 7-9 月龄 5xFAD 小鼠在任务学习中表现出显著缺陷,但 2-4 月龄小鼠表现正常,从而能够在行为衰退之前评估海马编码。在这一早期阶段,CA1 神经元表现出完整的全局空间编码,但任务相关位置细胞表征受损。由轨迹依赖编码揭示的情境表征在群体和单细胞水平均被削弱,并伴随在行为期间从以回溯性为主向更多前瞻性编码的显著转变。
【主题与分类】
主题标签:Neuroscience、Alzheimer's disease、Cognitive neuroscience。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3A3674bbac9e020cd02ba7f4a5afa2a637658339364fe7a5de284015c039657d43
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
阿尔茨海默病(AD)以进行性记忆衰退为特征,然而在AD早期阶段海马表征如何变化在很大程度上仍不清楚。在本研究中,我们采用真实世界的头部固定空间交替任务,结合在体双光子成像,研究5xFAD小鼠海马CA1表征。虽然7-9月龄5xFAD小鼠在任务学习中表现出显著缺陷,但2-4月龄小鼠表现正常,这使得我们能够在行为衰退之前评估海马编码。在这一早期阶段,CA1神经元表现出完整的全局空间编码,但任务相关的位置细胞表征受损。由轨迹依赖性编码所揭示的情境表征在群体和单细胞水平上均被削弱,并伴随着行为选择过程中从以回顾性编码为主向更多前瞻性编码的显著转变。
在任务学习过程中,纵向不稳定的位置细胞表现出更严重的损伤……,# 数据和代码来源:早期空间和情境编码缺陷在海马CA1区先于阿尔茨海默病模型中的表现衰退 ## 概述 本数据包包含处理后的数据和MATLAB代码,用于生成相关手稿中的主要图表和统计分析。它还包含了用于图1示例的代表性行为轨迹和钙成像时间序列。图表工作簿包含了绘图脚本使用的最终数值输入。这些是处理后的数据,而非原始显微镜电影或原始采集文件。 ## 目录结构 ```text Dryad_dataset/ |-- README.md |-- analysis_code/ | |-- Fig1/ | |-- Fig2/ | |-- Fig3/ | |-- Fig4/ | |-- Fig5/ | |-- Fig6/ | -- useful_function/ | |-- box_violin_plot.m | – plot_ROIwave.m |-- figure_data/ | |-- figure_1.xlsx | |-- figure_2.xlsx | |-- figure_3.xlsx | |-- figure_4.xlsx | |-- figure_5.xlsx | `-- figure_6.xlsx |-- behavi…,
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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