小脑阿尔茨海默病数据集

该数据集来源于ebi.ac.uk,包含从阿尔茨海默病患者小脑脑组织样本中获取的离子通道剪接阵列数据。研究将对照受试者的颞叶皮层(阿尔茨海默病受累脑组织结构)和小脑(阿尔茨海默病未受累脑组织结构)样本,与阿尔茨海默病患者的颞叶皮层和小脑进行了比较

biostudies
浏览 8
基因组分类unknown experiment typeHomo sapiens
Cerebellum Alzheimer's Disease

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

小脑阿尔茨海默病数据集

Cerebellum Alzheimer's Disease 数据集收录于 ebi.ac.uk,归类于神经系统疾病 / 阿尔茨海默病方向,主题标签涉及未知实验类型与 Homo sapiens。该数据集的核心内容是从阿尔茨海默病患者小脑脑组织样本中获取的离子通道剪接阵列数据。研究设计将对照受试者的颞叶皮层(阿尔茨海默病受累脑组织结构)和小脑(阿尔茨海默病未受累脑组织结构)样本,与阿尔茨海默病患者的颞叶皮层和小脑进行了比较,旨在从离子通道剪接这一层面观察阿尔茨海默病在不同脑区中的分子变化特征。数据集英文名称为 Cerebellum Alzheimer's Disease,来源站为 ebi.ac.uk。

【数据集背景】

阿尔茨海默病是一种以认知功能进行性减退为主要表现的神经系统疾病,其病理改变在脑内并非均匀分布。颞叶皮层通常被认为是阿尔茨海默病受累的脑组织结构,而小脑则被视为相对未受累的脑组织结构。该数据集正是基于这一脑区差异开展研究,通过比较受累与未受累脑区在离子通道剪接层面的表现,为理解阿尔茨海默病的区域选择性易损机制提供数据基础。数据集来源站为 ebi.ac.uk,所属分类为神经系统疾病 / 阿尔茨海默病。

【数据内容】

该数据集包含离子通道剪接阵列数据,样本来自小脑脑组织。研究对象涵盖阿尔茨海默病患者与对照受试者,涉及的脑组织包括颞叶皮层和小脑。具体而言,数据集中既有对照受试者的颞叶皮层和小脑样本,也有阿尔茨海默病患者的颞叶皮层和小脑样本,通过阵列技术检测离子通道相关的剪接变化。主题标签中标注了 Homo sapiens,表明样本来源于人类;实验类型标注为未知实验类型。关于阵列平台、探针数量、基因覆盖范围、样本量等更细粒度的信息,源站未提供。

【采集与来源】

数据采集自脑组织样本,来源站为 ebi.ac.uk。样本类型包括阿尔茨海默病患者的小脑脑组织,以及对照受试者和患者的颞叶皮层与小脑组织。源站描述指出,研究比较了对照受试者的颞叶皮层和小脑与阿尔茨海默病患者的颞叶皮层和小脑。关于样本采集的具体机构、伦理审批信息、供体数量、年龄分布、性别构成、取材时间及保存方式等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于围绕阿尔茨海默病脑区差异开展的研究,尤其是关注离子通道剪接变化的分析。由于数据同时涵盖受累脑区(颞叶皮层)与未受累脑区(小脑),可用于比较两类脑区在阿尔茨海默病状态下的分子表现差异。也可用于探索离子通道剪接事件是否与阿尔茨海默病的区域选择性病理相关。此外,该数据集可作为神经系统疾病相关转录后调控研究的参考数据。关于具体分析流程、统计方法或验证实验的适用性,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过来源站 ebi.ac.uk 获取。使用时应关注样本的脑区来源与疾病状态分组,即对照受试者与阿尔茨海默病患者的颞叶皮层和小脑。由于主题标签标注为未知实验类型,使用前需结合源站提供的原始描述确认数据结构与格式。关于数据下载方式、文件格式、预处理步骤、标准化方法及配套分析工具,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的主题标签将实验类型标注为未知实验类型,可能影响使用者对数据生成方式的直接判断。数据集聚焦于小脑脑组织样本的离子通道剪接阵列数据,并涉及颞叶皮层与小脑的比较,但关于样本量、重复数、批次效应、数据完整性及质控指标等信息,源站未提供。因此,在解释结果时需注意这些未明确的因素可能带来的影响。关于数据的具体局限性说明,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源站为 ebi.ac.uk。关于引用方式、许可协议、使用条款及数据再分发规定,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-6777

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

E-GEOD-6777 Cerebellum Alzheimer’s Disease unknown experiment type Homo sapiens Ion channel splice array data from cerebellum brain tissue samples collected from Alzheimer’s disease patients. Temporal cortex (Alzheimer’s disease affected brain tissue structure) and cerebellum (Alzheimer’s disease

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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