阿尔茨海默病前额叶皮层细胞特异性蛋白表达

该数据集来自 search.dataone.org,聚焦阿尔茨海默病(AD)前额叶皮层的细胞特异性蛋白表达。研究使用 GeoMx Digital Spatial Profiler(DSP)平台检测 AD 与非 AD 脑组织中的蛋白水平,共 interrogated 76 种蛋白,并通过免疫荧光区分三

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蛋白质分类Spatial proteomicsBrain Cell TypesAlzheimer's disease
Cell-specific protein expression in Alzheimer's disease prefrontal cortex

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

阿尔茨海默病前额叶皮层细胞特异性蛋白表达

Cell-specific protein expression in Alzheimer's disease prefrontal cortex

该数据集来自 search.dataone.org,聚焦阿尔茨海默病(AD)前额叶皮层的细胞特异性蛋白表达。研究使用 GeoMx Digital Spatial Profiler(DSP)平台检测 AD 与非 AD 脑组织中的蛋白水平,共 interrogated 76 种蛋白,并通过免疫荧光区分三种细胞类型。结果显示,促进 Aβ 降解的 Neprilysin 在 AD 神经元和小胶质细胞中显著升高,LAMP2A 在 AD 个体神经元中高于对照组,CD11c、CD11b、CD163 等神经炎症标志物在 AD 神经元中也升高。该数据可用于 AD 脑蛋白质组的空间与细胞类型分析(来源 DataONE)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):分析不同脑细胞类型的蛋白质组是理解阿尔茨海默病(AD)病理生理学的基础。然而,对这些多样且有限的细胞群体进行空间分析面临重大挑战。GeoMx Digital Spatial Profiler(DSP)平台分析了 AD 和非 AD 脑前额叶皮层中的蛋白质水平。该平台检测了 76 种蛋白质,并使用免疫荧光区分三种细胞类型。促进 Aβ 降解的 Neprilysin 在 AD 神经元和小胶质细胞中显著更高。与对照组相比,AD 个体神经元中的 LAMP2A 水平更高。此外,神经炎症标志物,如 CD11c、CD11b 和 CD163,在 AD 神经元中也升高。我们的研究结果表明,DSP 平台有效促进了 AD 脑蛋白质组的细胞特异性快照。

【主题与分类】

主题标签:Spatial proteomics、Brain Cell Types、Alzheimer's disease。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。

【获取与许可】

源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3A10ebdb73c102ebfda931179e723d6e26f9318d838b2e509129f46b17786824a7

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

分析不同脑细胞类型的蛋白质组是理解阿尔茨海默病(AD)病理生理学的基础。然而,对这些多样且有限的细胞群体进行空间分析面临着重大挑战。GeoMx数字空间分析仪(DSP)平台分析了AD和非AD大脑前额叶皮层的蛋白质水平。该平台检测了76种蛋白质,并使用免疫荧光区分三种细胞类型。促进Aβ降解的脑啡肽酶在AD神经元和小胶质细胞中显著升高。与对照组相比,AD患者神经元中的LAMP2A水平更高。此外,神经炎症标志物,如CD11c、CD11b和CD163,在AD神经元中也升高。我们的研究结果表明,DSP平台有效地促进了AD脑蛋白质组的细胞特异性快照。,# 阿尔茨海默病前额叶皮层中的细胞特异性蛋白质表达 数据集DOI: https://doi.org/10.5061/dryad.w6m905r12 #### 一般信息 **1.

研究目的: 本数据集支持一项空间蛋白质组学研究,旨在探究阿尔茨海默病(AD)前额叶皮层(Brodmann 8/9区)中蛋白质表达的细胞特异性改变。该分析旨在表征AD与对照样本在细胞水平上蛋白质特征的差异,重点关注神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞。2. 作者信息: * 主要研究者联系信息 姓名:Mohammad Haeri, MD PhD 机构:堪萨斯大学医学中心 邮箱:mhaeri@kumc.edu * 第一作者联系信息 姓名:Maryam Gholampour, PharmD 机构:堪萨斯大学医学中心 邮箱:mgholampour@kumc.edu 3. 数据采集日期: 2022-2023年 **4. 地理位置……,堪萨斯大学医学中心人体受试者委员会(KUMC HSC)已批准所有涉及人体受试者的研究,并且……

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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