阿尔茨海默病异构化数据集

该数据集来源于omicsdi.org,聚焦阿尔茨海默病(AD)中的氨基酸异构化现象。通过数据非依赖采集质谱技术,在复杂蛋白质混合物中表征异构化,并分析了大样本脑组织队列,揭示tau蛋白异构化与AD状态之间的显著关联

omicsdi
浏览 6
蛋白质分类Proteomics
Alzheimer's Disease Isomerization

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

阿尔茨海默病异构化数据集

阿尔茨海默病(Alzheimer's Disease, AD)是一种以认知功能进行性衰退为特征的神经系统疾病,其发病机制至今尚未完全阐明。氨基酸异构化作为一种自发发生的化学修饰,被认为可能与阿尔茨海默病的深层病因相关。该数据集聚焦于阿尔茨海默病中的氨基酸异构化现象,借助数据非依赖采集质谱技术,在复杂蛋白质混合物中对该修饰进行表征,并对大样本脑组织队列展开分析,揭示了tau蛋白异构化与AD状态之间的显著关联。数据表明,无论在常染色体显性遗传还是散发性AD样本中,异构化的丰度均高于对照组,为理解AD的分子病理提供了新的蛋白质组学视角。

【数据集背景】

氨基酸异构化是一种自发发生的化学修饰,可能参与阿尔茨海默病的潜在病因。围绕这一科学问题,相关研究致力于建立能够在复杂蛋白质混合物中表征异构化的方法,并考察其与AD状态之间的关系。该数据集正是在这一背景下产生,属于神经系统疾病中阿尔茨海默病方向的研究数据,主题归属于蛋白质组学。

【数据内容】

数据集的核心内容涉及对脑组织样本中氨基酸异构化的大规模考察。研究对一个大样本脑组织队列进行了分析,发现tau蛋白的异构化与AD状态之间存在显著关系。值得注意的是,异构化在常染色体显性AD与散发性AD样本中均较对照组更为丰富。此外,数据还包含与自噬相关的蛋白质的定量分析结果,例如tau蛋白的异构化与p62水平呈正相关,而p62是公认的自噬抑制指标。这些内容共同构成了支持“AD脑中自噬流降低”这一假设的证据基础。

【采集与来源】

该数据集来源于omicsdi.org。其技术基础为数据非依赖采集质谱,该方法被用于在复杂蛋白质混合物中表征异构化。样本层面涉及大样本脑组织队列的检测与分析。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于与阿尔茨海默病相关的蛋白质组学研究场景,尤其是围绕氨基酸异构化这一化学修饰的探索,包括tau蛋白异构化与AD状态的关联分析、常染色体显性AD与散发性AD样本的比较,以及自噬相关蛋白定量与异构化关系的考察。对于关注AD分子病理机制、自噬通路与蛋白质修饰交叉方向的研究者,该数据具有参考价值。

【使用方法】

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【质量与限制】

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【引用与许可】

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/panorama/PXD025668

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

氨基酸异构化是一种自发的化学修饰,可能与阿尔茨海默病(AD)的潜在病因相关。我们证明,数据非依赖性采集质谱可用于表征复杂蛋白质混合物中的异构化。对一大群脑样本的检查揭示了tau蛋白异构化与AD状态之间显著的关系。令人惊讶的是,相对于对照组,异构化在常染色体显性和散发性AD样本中均更为丰富。我们假设AD脑中较低的自噬通量可解释这些结果。其他数据有力地支持了这一假设,包括对自噬相关蛋白的定量分析。例如,tau蛋白的异构化与p62水平呈正相关,而p62是公认的自噬抑制指标。总之,这些数据表明异构化与自噬通量之间存在密切联系,因此后者可能成为未来AD治疗和预防研究的一个有前景的靶点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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