AddNeuroMed队列阿尔茨海默病、MCI与对照样本(批次1)

该数据集来自欧盟资助的AddNeuroMed队列,为跨欧洲的阿尔茨海默病生物标志物研究,以人血作为RNA来源。数据采用病例对照设计,样本包括阿尔茨海默病患者、轻度认知障碍受试者以及年龄和性别匹配的对照

omicsdi
浏览 7
基因组分类Transcriptomics
Alzheimer, MCI and control samples from AddneuroMed Cohort (batch 1)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

AddNeuroMed队列阿尔茨海默病、MCI与对照样本(批次1)

该数据集英文名为 Alzheimer, MCI and control samples from AddneuroMed Cohort (batch 1),归属于神经系统疾病 / 阿尔茨海默病分类,来源于 omicsdi.org。数据集样本来自欧盟资助的 AddNeuroMed 队列,这是一个大型跨欧洲阿尔茨海默病生物标志物研究项目,以人血作为 RNA 来源。研究采用病例对照设计,样本涵盖阿尔茨海默病患者、轻度认知障碍受试者以及年龄和性别匹配的对照。数据集的主题标签为 Transcriptomics,即转录组学。整体而言,该数据集为在转录组层面比较阿尔茨海默病、轻度认知障碍与正常对照之间的差异提供了样本资源,适合围绕阿尔茨海默病外周血基因表达特征开展病例对照分析。

【数据集背景】

该数据集依托的 AddNeuroMed 队列是欧盟资助的大型跨欧洲阿尔茨海默病生物标志物研究项目。该队列以人血作为 RNA 来源,采用病例对照设计开展研究。阿尔茨海默病是一种神经系统疾病,轻度认知障碍通常被视为介于正常认知与痴呆之间的过渡状态,因此同时纳入阿尔茨海默病患者、轻度认知障碍受试者与认知正常对照,有助于在疾病不同阶段观察生物标志物的变化。该数据集即为该队列 batch 1 的样本集合,主题属于转录组学范畴。

【数据内容】

数据集包含三类样本:阿尔茨海默病患者、轻度认知障碍受试者,以及年龄和性别匹配的对照。样本的生物学来源为人血,检测层面为转录组学。病例对照设计意味着样本按疾病状态分组,便于开展组间比较。关于样本的具体数量、测序平台、基因表达矩阵的格式与维度、是否附带临床变量(如年龄、性别、认知评分等)的详细字段,源站未提供。

【采集与来源】

样本来源于欧盟资助的 AddNeuroMed 队列,该队列是一项跨欧洲的阿尔茨海默病生物标志物研究,以人血作为 RNA 来源。数据集通过 omicsdi.org 发布,本站分类为神经系统疾病 / 阿尔茨海默病。关于具体的采血流程、RNA 提取方法、样本入库与处理时间、参与中心分布等细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其病例对照设计与三类样本构成,该数据集适用于转录组层面的组间比较研究,例如比较阿尔茨海默病患者、轻度认知障碍受试者与年龄性别匹配对照之间的人血 RNA 表达差异,探索与疾病状态相关的表达特征。也可用于生物标志物发现方向的探索性分析,以及作为外周血转录组研究的方法学验证素材。需要说明的是,上述用途为基于数据类型的一般性应用方向,源站未提供针对该数据集的具体应用结论。

【使用方法】

使用时应按病例状态对样本进行分组,并利用年龄和性别匹配的对照设计控制混杂因素。分析前需确认表达数据的预处理方式与批次信息(该数据集为 batch 1)。关于数据文件的具体格式、下载方式、预处理步骤与推荐分析流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 batch 1,提示可能存在后续批次,跨批次整合时需考虑批次效应。样本量、数据完整性、缺失值情况、质控指标等均源站未提供。由于以人血 RNA 为来源,其结果反映的是外周血转录组特征,向中枢神经系统病理的推演需谨慎。此外,病例对照设计本身在因果推断上存在固有局限。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、原始文献、许可协议与使用条款,源站未提供。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-63060

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

阿尔茨海默病病例对照样本来源于欧盟资助的AddNeuroMed队列,这是一项大型跨欧洲的阿尔茨海默病生物标志物研究,以人血作为RNA来源。研究设计为病例对照。病例包括阿尔茨海默病患者、轻度认知障碍受试者,或年龄和性别相匹配的对照。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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