急性分离小鼠皮层星形胶质细胞与小胶质细胞：阿尔茨海默病对比野生型

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-74615

标准获取流程：

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数据说明

从阿尔茨海默病小鼠中分离胶质细胞揭示炎症与功能障碍。在阿尔茨海默病(AD)中，反应性星形胶质细胞和小胶质细胞与淀粉样斑块相关联。然而，对于这种反应性表型背后的分子改变知之甚少。为了深入了解AD诱导的星形胶质细胞和小胶质细胞反应性的分子变化，我们对来自老年对照组和APPswe/PS1dE9 AD小鼠皮层的急性分离星形胶质细胞和小胶质细胞进行了转录分析。正如预期，两种细胞类型均获得了促炎表型，这证实了我们方法的有效性。有趣的是，我们观察到星形胶质细胞中的免疫改变相对比小胶质细胞更为显著。同时，我们的数据揭示，星形胶质细胞显示神经元支持基因和参与神经元通讯的基因表达减少。小胶质细胞则显示出吞噬作用和/或内吞作用基因的表达减少。

对人AD表达数据集与星形胶质细胞和小胶质细胞数据集进行的共表达分析显示，星形胶质细胞中的炎症变化在小鼠和人AD中极为相似，而小胶质细胞的变化则相似性较低。基于这些发现，我们认为，长期促炎性星形胶质细胞和小胶质细胞表型——表现为参与神经元支持和神经元信号传导的基因减少——很可能促进了AD中的神经元功能障碍和认知衰退。来自2种条件的2种细胞类型：来自15-18月龄APPswe/PS1dE9小鼠的皮层小胶质细胞和皮层星形胶质细胞，与野生型同窝仔鼠进行比较。生物学重复：来自APPswe/PS1dE9的小胶质细胞，N=7，来自WT的小胶质细胞，N=7，来自APPswe/PS1dE9的星形胶质细胞，N=4，来自WT的小胶质细胞，N=4

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。