阿尔茨海默病与韧性中基于化学蛋白质组学的ABPP

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD057993

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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数据说明

对36名患者（12名对照、12名阿尔茨海默病患者、12名韧性个体）额叶皮层裂解物中由丝氨酸水解酶探针四氢利普司他汀-生物素和氟膦酸酯生物素探针所靶向的酶进行pull-down分析。摘要如下：阿尔茨海默病（AD）是最常见的痴呆形式。尽管脂质代谢的改变与AD相关已日益明确，但其如何同时导致认知衰退和AD病理生理学仍不甚清楚。为更好地理解这些变化，我们在一个由对照、AD和韧性供体组成的队列的额叶皮层中进行了脂质组学和活性基础蛋白质组学分析（ABPP），其中韧性供体指的是具有AD病理但认知未衰退的个体。我们证明脂质组中的大多数变化与AD病理相关。变化最强烈的脂质类别是ω6衍生的氧化脂质，其反映神经炎症反应。与对照组相比，该脂质类别在AD患者中尤其增加，而在韧性供体中显示出相似但不显著的趋势。

相比之下，与韧性供体相比，AD供体中三酰甘油（TAGs）和脂滴均更为丰富，但与对照供体相比则不然，这表明韧性供体中的中性脂质发生了改变。通过ABPP分析的酶活性在AD和韧性供体中显示出相似的方向，包括ABHD6活性降低，ABHD6是一种参与单酰甘油代谢的脂肪酶。最后，利用多组学因子分析，我们表明氧脂素增加、抑制性细胞丢失和突触可塑性降低与Aβ斑块负荷相关。这一反应在AD和韧性供体中均存在。综上所述，我们的多组学数据显示，AD和韧性供体之间存在与Aβ负荷相关的共同反应，并且首次发现韧性供体中脂滴减少。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。