5xFAD转基因小鼠Aβ蛋白变体

研究采用免疫富集结合定量Top-Down质谱技术,评估与淀粉样变性相关的Aβ蛋白变体通量。5xFAD小鼠是研究年龄依赖性Aβ淀粉样变性的经典模型,因此该数据可用于探索阿尔茨海默病中Aβ蛋白变体的动态变化、结构异质性及其在淀粉样变性进程中的作用,为相关机制研究和潜在干预靶点提供质谱层面的定量证据(来源

omicsdi
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基因组分类Amyloid betaAlzheimer’s diseaseTransgenic mouse model5xfadTop-down mass spectrometry
5xFAD transgenic mouse Abeta proteoforms

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

5xFAD转基因小鼠Aβ蛋白变体

数据集聚焦于阿尔茨海默病相关淀粉样变性机制研究,依托免疫富集与定量Top-Down质谱技术,对经典5xFAD小鼠模型中与淀粉样变性相关的Aβ蛋白变体通量进行系统评估。该数据集属于神经系统疾病/阿尔茨海默病方向,来源为omicsdi.org,主题涵盖淀粉样蛋白β、阿尔茨海默病、转基因小鼠模型、5xFAD以及Top-Down质谱等关键概念。整体而言,该数据可为探索年龄依赖性Aβ淀粉样变性过程中Aβ蛋白变体的动态变化、结构异质性及其病理作用提供质谱层面的定量证据,并有助于相关机制研究与潜在干预靶点的发现。

【数据集背景】

阿尔茨海默病是一种以淀粉样蛋白β沉积为核心病理特征之一的神经退行性疾病。Aβ蛋白变体(proteoform)指同一基因产物在翻译后修饰、截断或其他结构变化下形成的多种分子形式,这些变体可能与淀粉样变性的发生和进展密切相关。5xFAD小鼠是研究年龄依赖性Aβ淀粉样变性的经典转基因模型,被广泛用于模拟与Aβ相关的病理过程。该数据集正是在这一背景下,针对5xFAD小鼠模型中的Aβ蛋白变体展开研究,旨在从蛋白变体层面理解淀粉样变性的分子基础。

【数据内容】

该数据集围绕5xFAD转基因小鼠的Aβ蛋白变体展开,核心内容涉及与淀粉样变性相关的Aβ蛋白变体通量评估。研究采用免疫富集结合定量Top-Down质谱技术,对Aβ蛋白变体进行检测与定量分析。主题标签包括淀粉样蛋白β、阿尔茨海默病、转基因小鼠模型、5xfad和Top-down mass spectrometry,反映出数据内容在分子对象、疾病背景、模型系统和技术手段上的多维覆盖。关于具体样本数量、蛋白变体种类、定量数值、质谱参数等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于omicsdi.org。根据源站描述,研究在已被广泛研究的5xFAD小鼠模型中,使用免疫富集和定量Top-Down质谱技术,评估与淀粉样变性相关的Aβ蛋白变体通量。该模型本身具有年龄依赖性Aβ淀粉样变性的特征,因此数据采集与这一病理进程密切相关。关于样本采集时间点、组织来源、免疫富集的具体抗体或流程、质谱仪器型号及采集参数等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于阿尔茨海默病中Aβ蛋白变体相关的研究场景,包括探索Aβ蛋白变体的动态变化、结构异质性及其在淀粉样变性进程中的作用。由于数据基于5xFAD转基因小鼠模型并采用定量Top-Down质谱技术,其潜在应用还包括为相关机制研究提供质谱层面的定量证据,以及为潜在干预靶点的发现提供参考。关于该数据是否适用于其他疾病模型、临床样本或药物筛选等具体场景,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过omicsdi.org获取。关于数据的具体使用方式,例如文件格式、数据结构、是否提供原始质谱数据、是否附带分析流程或代码、是否需要特定软件处理等,源站未提供。使用者如需进一步分析,应参考源站提供的相关说明或原始研究信息。

【质量与限制】

该数据集基于免疫富集与定量Top-Down质谱技术,针对5xFAD小鼠模型中的Aβ蛋白变体通量进行评估,具有明确的技术路线和模型背景。然而,关于数据质量指标、定量准确性、重复性、覆盖度、批次效应、样本量及潜在偏差等具体信息,源站未提供。此外,该数据基于转基因小鼠模型,其结论向人类阿尔茨海默病的外推程度需谨慎对待,相关限制信息源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款及版权信息,源站未提供。使用者应访问omicsdi.org查询相关说明,并遵循源站及原始研究发布的引用与许可要求。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD042921

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在本研究中,我们利用免疫富集和定量自上而下质谱法,在已被充分研究的年龄依赖性Aβ淀粉样变性5xFAD小鼠模型中,评估了与淀粉样变性相关的Aβ蛋白质形态流。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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