儿童肾癌类器官生物库
儿童肾癌类器官生物库，涵盖多种亚型肿瘤类器官及正常对照，提供Illumina EPIC微阵列甲基化数据。
基本信息
资源简介
儿童肾癌类器官生物库
【一句话概览】
本数据集是 NCBI 公开的组学数据集，收录 1 个文件，主题涵盖 GPL13534、9606，可用于生物标志物发现与分子分型研究。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《An Organoid Biobank for Childhood Kidney Cancers that Captures Disease and Tissue Heterogeneity》。源站首次发布：Sep 16 201。
【数据内容】
源站原始描述：Kidney tumours are among the most common solid tumours in children, comprising several distinct subtypes differing in many aspects, including cell-of-origin, genetics, and pathology. Pre-clinical cell models capturing the disease heterogeneity are currently lacking. Here, we describe the first paediatric cancer organoid biobank. It contains tumour and matching normal kidney organoids from over 50 children with different subtypes of kidney cancer, including Wilms tumours, malignant rhabdoid tumou…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：GPL13534、9606。
【适用方向】
组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE137544
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 23 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE137544
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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