晚期胃癌脾虚毒蕴证肠道菌群16S rRNA基因谱
该数据集为 NCBI BioProject ID 1520039，主题为晚期胃癌脾虚毒蕴证患者肠道菌群的 16S rRNA 基因谱分析，数据以原始测序读长形式提供
基本信息
资源简介
晚期胃癌脾虚毒蕴证肠道菌群16S rRNA基因谱
该数据集为 NCBI BioProject 收录项目，编号 1520039，英文名称为“16S rRNA gene profiling of gut microbiota in advanced gastric cancer with spleen-deficiency and toxin-accumulation syndrome”。从名称与主题标签来看，该项目聚焦晚期胃癌患者中脾虚毒蕴证这一特定中医证候人群的肠道菌群，采用 16S rRNA 基因谱分析手段，数据以原始测序读长形式提供。本站将其归类于肿瘤 / 胃癌方向，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 作为生物数据集合，通常围绕某一项研究计划或机构、联盟发起，为用户提供统一入口，以便链接到该项目所产生的多种数据类型。因此，该数据集可视为一个以胃癌肠道菌群为研究对象的原始测序数据入口，便于后续检索、下载与再分析。
【数据集背景】
该数据集对应的 BioProject 编号为 1520039，其英文名称明确指向晚期胃癌合并脾虚毒蕴证患者的肠道菌群 16S rRNA 基因谱分析。胃癌是肿瘤领域的重要研究对象，而肠道菌群与肿瘤发生、发展及机体状态之间的关系，是微生物组研究中的常见方向。该项目将中医证候“脾虚毒蕴”纳入研究框架，提示其关注特定证候背景下肠道菌群的特征。源站描述指出，BioProject 记录旨在为某一研究计划所生成的不同数据类型提供统一查找入口，因此该数据集在 NCBI 体系内承担着项目级索引与数据链接的作用。本站分类将其归入肿瘤 / 胃癌，主题标签为“Raw sequence reads”，说明其对外提供的数据形态以原始测序读长为主。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，表明其核心数据为原始测序读长。项目名称涉及 16S rRNA 基因谱分析，说明测序对象为肠道菌群样本中的 16S rRNA 基因。数据以原始读长形式提供，意味着用户获取的是未经高级加工或汇总的测序序列，可用于后续微生物群落组成、多样性及分类学分析等。除上述信息外，关于样本数量、测序平台、读长长度、目标区域、数据量等具体指标，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI BioProject，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 1520039。源站描述说明，BioProject 可由单一组织或联盟发起，围绕单一研究计划汇集生物数据。该项目的英文名称显示其研究对象为晚期胃癌脾虚毒蕴证患者的肠道菌群。关于样本采集地点、采集时间、纳入排除标准、伦理审批信息、具体研究机构等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与胃癌肠道菌群相关的微生物组研究，尤其是关注晚期胃癌及脾虚毒蕴证候背景的 16S rRNA 基因谱分析。由于数据以原始测序读长形式提供，可用于重新进行序列质控、聚类、物种注释、多样性分析等。也可作为 BioProject 项目入口，用于查找该项目关联的其他数据类型。对于肿瘤 / 胃癌领域的微生物组比较研究、方法学验证或数据再利用，该数据集具有潜在参考价值。具体适用性需结合源站提供的完整项目信息与数据文件判断。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 编号 1520039 访问该项目记录，并依据源站提供的链接获取原始测序读长数据。由于主题标签为“Raw sequence reads”，使用前通常需要进行测序读长质控、拼接或去噪、嵌合体去除、分类学注释及下游统计分析。具体下载方式、文件格式、分析流程与软件参数，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 BioProject 记录，源站描述仅说明其作为数据集合与链接入口的性质。关于原始测序读长的质量评分、测序深度、样本重复、批次效应、污染控制等质量信息，源站未提供。由于仅能依据现有信息描述，无法对该数据集的数据完整性、准确性或适用范围作出进一步判断。用户在使用时应自行核查源站项目页面中的样本元数据与数据文件说明。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制或数据共享政策，源站未提供。用户在使用或发表相关分析结果前，应访问 NCBI BioProject 项目页面，查阅其最新的引用要求与许可条款。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1520039
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该BioProject包含来自30名参与者粪便样本的16S rRNA基因扩增子测序数据，其中包括15名辨证为脾虚毒蕴证的晚期胃癌患者（GC-SDTA）和15名健康对照者。使用引物338F和806R扩增细菌16S rRNA基因的V3-V4区，并在Illumina MiSeq平台上采用双端测序进行测序。这些数据是整合肠道微生物组、靶向代谢组学和血浆蛋白质组学的多组学研究的一部分。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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