GSE178318结直肠癌肝转移单细胞图谱

包含结直肠癌肝转移相关组织的单细胞RNA测序数据,用于研究肿瘤微环境和化疗反应。由NCBI Gene Expression Omnibus提供,来自GEO,数据格式为表格,包含19条数据记录,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的IV期(转移性)结肠癌研究。

NCBI Gene Expression OmnibusNCBI Gene Expression Omnibus
GEO
2021-09-20 更新
浏览 31
表格分类GPL246769606
GSE178318

基本信息

模态
表格
大小
0.547165184 GB
数据量
19
任务类型
分类
创建/更新时间
2021-09-20

资源简介

GSE178318结直肠癌肝转移单细胞图谱

【数据集背景】

本数据集源站标题为《A Single-Cell Atlas of Liver Metastases of Colorectal Cancer Reveals the Reprogramming of the Tumor Microenvironment in Response to Preoperative Chemotherapy》。源站首次发布:Jun 16 202。

【数据内容】

源站原始描述:Metastasis is the primary cause of cancer-related mortality in colorectal cancer (CRC) patients. How to improve therapeutic options for patients with metastatic CRC (mCRC) is the core question for CRC treatment. However, the complexity and diversity of stromal context of the tumor microenvironment (TME) in liver metastases of CRC is not fully understood, and its influence on response to chemotherapy is unclear. Here we provide an in-depth analysis of transcriptional landscape of primary CRC, mat…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by high throughput sequencing、GPL24676、9606。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE178318

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 20 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

包含结直肠癌肝转移相关组织的单细胞RNA测序数据,用于研究肿瘤微环境和化疗反应。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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