GSE110009结肠癌单细胞RNA测序数据集
包含6例结肠癌患者的正常组织、原发肿瘤和转移肿瘤单细胞RNA测序数据，适用于肿瘤异质性分析。由NCBI Gene Expression Omnibus提供，来自GEO，数据格式为表格，包含3585条数据记录，适用于分类任务，专注于肿瘤领域的IV期（转移性）结肠癌研究。
基本信息
资源简介
GSE110009结肠癌单细胞RNA测序数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Single cell transcriptome landscape of primary and metastatic tumor in colon cancer》。源站首次发布：Feb 01 201。
【数据内容】
源站原始描述：Colorectal Cancer ranks as the second-leading cause of cancer-related death worldwide. Recent progress in colon cancer research has vastly expanded our understanding of colon cancer on the cellular and molecular levels and have improved the survival of CRC patients considerably. However, most of these genomic and gene expression profiling were usually characterized by bulk tumor tissue. In order to further understanding colon cancer, knowledge at the single cell level is urgently needed and expe…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by high throughput sequencing、GPL20301、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE110009
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 03 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE110009
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含6例结肠癌患者的正常组织、原发肿瘤和转移肿瘤单细胞RNA测序数据，适用于肿瘤异质性分析。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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