PRJNA1422198：理解免疫治疗耐药机制与驱动因素的蛋白质基因组学研究
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1422198），主题为通过蛋白质基因组学研究理解免疫治疗耐药的机制与驱动因素，本站归类为肿瘤/皮肤癌
基本信息
资源简介
PRJNA1422198：理解免疫治疗耐药机制与驱动因素的蛋白质基因组学研究
PRJNA1422198 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的研究项目，其英文全称为“Proteogenomic studies to understand mechanisms and drivers of resistance to immunotherapies”。该项目聚焦于通过蛋白质基因组学手段，探索免疫治疗耐药的机制与驱动因素。从本站分类来看，该数据集归属于肿瘤领域下的皮肤癌方向，主题标签为“Phenotype or Genotype”。BioProject 作为生物数据的集合记录，通常围绕某一项单一研究计划而建立，来源于某个组织或联盟，并为用户提供统一入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。该项目正是以免疫治疗耐药为核心议题，借助蛋白质基因组学的研究思路，试图揭示耐药背后的生物学机制与关键驱动因子，为相关肿瘤（尤其是皮肤癌方向）的免疫治疗研究提供数据支撑。
【数据集背景】
该数据集来自 NCBI BioProject，项目编号为 1422198。其标题明确指向“通过蛋白质基因组学研究理解免疫治疗耐药的机制与驱动因素”。免疫治疗耐药是肿瘤治疗领域的重要挑战，而蛋白质基因组学结合了蛋白质组与基因组层面的信息，有助于从多维度理解耐药现象。本站将该数据集归类为肿瘤 / 皮肤癌，表明其研究背景与皮肤癌这一肿瘤类型密切相关。主题标签“Phenotype or Genotype”进一步提示该项目可能涉及表型或基因型层面的数据内容。BioProject 作为一项研究计划的集合记录，旨在将同一项目下产生的多样数据类型汇聚于一处，方便用户发现和访问。
【数据内容】
源站描述指出，BioProject 记录本身是围绕单一研究计划收集的生物数据集合，来源于单一组织或联盟，并提供用户一个单一位置来查找该项目所产生的多样数据类型。因此，该数据集的内容应涵盖与“蛋白质基因组学研究免疫治疗耐药机制与驱动因素”相关的多种生物数据。然而，关于具体的数据类型、样本数量、组学层次、文件格式等细节，源站未提供。本站分类为肿瘤 / 皮肤癌，主题标签为“Phenotype or Genotype”，这些信息可作为理解数据内容方向的参考，但具体数据内容仍需以源站记录为准。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，具体收录于 NCBI BioProject 数据库，项目 ID 为 1422198。源站描述说明，BioProject 记录来源于单一组织或联盟，是围绕某一研究计划而建立的生物数据集合。因此，该项目的采集与来源应归属于发起该研究计划的组织或联盟。但关于具体的采集机构、研究团队、样本采集地点、采集时间等详细信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与免疫治疗耐药机制及驱动因素相关的研究场景，尤其是结合蛋白质基因组学方法探索肿瘤（特别是皮肤癌）免疫治疗耐药的研究。主题标签“Phenotype or Genotype”提示其可能适用于表型或基因型关联分析。此外，由于 BioProject 提供多种数据类型的链接入口，该数据集也可用于跨组学数据的整合分析、生物标志物发现或耐药机制验证等研究方向。但具体的适用场景需结合源站提供的实际数据内容确定，源站未提供更详细的适用说明。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问该项目记录，项目 ID 为 1422198。BioProject 记录提供单一位置以查找该项目产生的多样数据类型，用户可据此定位并获取相关数据。关于具体的数据下载方式、分析工具、使用协议或操作步骤，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject，属于生物数据集合记录。源站描述未提供关于数据质量、完整性、准确性或技术偏倚等方面的具体信息。由于具体的数据类型、样本规模、实验设计等细节尚未提供，使用者在解释和利用该数据集时需注意其局限性。本站分类为肿瘤 / 皮肤癌，主题标签为“Phenotype or Genotype”，这些分类信息可能有助于初步筛选，但不能替代对源站原始记录的详细审查。质量与限制的具体内容，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或版权信息，源站未提供。用户在使用该数据集时，应参考 NCBI BioProject 数据库的通用引用规范及源站记录中可能列出的具体说明。由于源站未提供明确的引用与许可信息，建议直接访问 NCBI BioProject 项目页面（ID 1422198）获取最新、最准确的引用与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1422198
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
靶向程序性死亡蛋白（PD-1）和细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4（CTLA-4）的免疫检查点抑制剂（ICIs）在晚期皮肤黑色素瘤中可产生持久缓解，但可靠的预测性生物标志物仍难以确定。我们对转移性皮肤黑色素瘤患者的治疗前福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）活检组织进行了多队列蛋白质基因组学研究，这些患者随后接受了PD-1+CTLA-4 ICI双联治疗或PD-1 ICI单药治疗。来自美国、欧洲和澳大利亚12个研究中心的3个队列的肺、淋巴结和皮肤黑色素瘤转移灶被收集，包括两个独立的PD-1+CTLA-4 ICI治疗发现和验证队列（“发现队列”和“验证队列1”，n=164份样本），以及一个PD-1……（更多内容见dbGaP研究页面。）
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
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