PRJNA1404897:RNA-seq原始数据
该数据集为 B16-F10 黑色素瘤小鼠模型的 RNA-seq 原始测序数据,涵盖低强度(1-1.5 V/cm)和高强度(2-2.5 V/cm)交替电场(AEF)处理及假处理对照组

基本信息
资源简介
PRJNA1404897:RNA-seq原始数据
该数据集为 B16-F10 黑色素瘤小鼠模型的 RNA-seq 原始测序数据,涵盖低强度(1-1.5 V/cm)和高强度(2-2.5 V/cm)交替电场(AEF)处理及假处理对照组。数据可用于分析 AEF 对肿瘤基因表达和免疫通路的影响,尤其是 DAPK2-LRPPRC-STING 信号链及 CD8+ T 细胞应答,适合研究物理疗法改变肿瘤微环境以提升免疫治疗效果的课题(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含来自在 C57BL/6 小鼠中生长的 B16-F10 黑色素瘤肿瘤的 RNA 测序(RNA-seq)数据。该研究考察了非侵入性交替电场(AEFs)如何影响难以治疗的“冷”肿瘤中的免疫反应。小鼠接受了低强度(1-1.5 V/cm)或高强度(2-2.5 V/cm)AEF 治疗,并设有假处理对照组。数据显示 AEFs 如何改变肿瘤中的基因活性,突出关键免疫通路,尤其是 DAPK2-LRPPRC-STING 信号链,这有助于解释这种物理治疗如何增强机体自身的 CD8+ T 细胞来对抗癌症。该资源对于研究物理疗法如何改变肿瘤环境以改善免疫治疗的研究人员很有用。
【主题与分类】
主题标签:Raw sequence reads。本站分类:肿瘤/皮肤癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1404897
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含来自在C57BL/6小鼠体内生长的B16-F10黑色素瘤的RNA测序(RNA-seq)数据。该研究探讨了非侵入性交变电场(AEFs)如何影响难以治疗的“冷”肿瘤中的免疫反应。小鼠接受了低强度(1-1.5 V/cm)或高强度(2-2.5 V/cm)AEF治疗,并设有假处理对照组。数据展示了AEFs如何改变肿瘤中的基因活性,突出了关键免疫通路,尤其是DAPK2-LRPPRC-STING信号链,这有助于解释这种物理治疗如何增强机体自身的CD8+ T细胞来对抗癌症。该资源对于研究物理疗法如何改变肿瘤环境以改善免疫治疗的研究人员很有用。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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