肢端黑色素瘤TIL治疗的单细胞转录组与TCR图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1381235

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目包含来自晚期肢端黑色素瘤患者肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）治疗样本的单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞T细胞受体（TCR）测序数据。从参加过继性TIL治疗临床试验的四名患者中采集了新鲜肿瘤组织、自体TIL输注产品和外周血单核细胞（PBMC）。样本包括原发或转移性肿瘤病灶、输注的TIL产品，以及TIL输注后多个时间点采集的纵向PBMC标本。使用10x Genomics Chromium平台进行单细胞转录组分析，以表征肿瘤和外周隔室中的免疫细胞组成、功能状态和克隆动态。该数据集可用于详细分析T细胞亚群，包括细胞毒性、耗竭和T滤泡辅助（Tfh）细胞群，以及将转录组状态与TCR克隆型信息进行整合。

这些数据为研究肢端黑色素瘤中TIL疗法的临床反应及耐药性背后的免疫机制，以及与其他免疫治疗数据集进行比较分析提供了资源。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。