E-MTAB-9273:SB202190或BIRB796处理人黑色素瘤细胞系A375m2对比DMSO对照的RNA-seq
数据覆盖药物扰动下的转录组表达谱,可用于差异表达分析、药物响应机制探索以及黑色素瘤相关转录调控研究(来源 ebi.ac.uk)

基本信息
资源简介
E-MTAB-9273:SB202190或BIRB796处理人黑色素瘤细胞系A375m2对比DMSO对照的RNA-seq
E-MTAB-9273 是一项针对人源黑色素瘤细胞系 A375m2 的 RNA-seq 转录组实验,属于 Expression Atlas 中的差异表达实验(Differential)。该实验以 DMSO 处理组为对照,考察 SB202190 或 BIRB796 两种化合物处理后的基因表达变化,物种为 Homo sapiens。数据集在分类上归入肿瘤/皮肤癌方向,来源站点为 ebi.ac.uk。整体而言,该数据提供了药物扰动条件下黑色素瘤细胞的转录组表达谱,可用于差异表达分析、药物响应机制探索以及黑色素瘤相关转录调控研究。
【数据集背景】
该数据集聚焦于黑色素瘤这一皮肤癌类型的细胞模型研究。实验采用人源黑色素瘤细胞系 A375m2 作为研究对象,通过 RNA-seq 技术获取转录组层面的表达信息。实验设计包含两类药物处理条件(SB202190 与 BIRB796)以及 DMSO 对照,属于典型的差异表达实验设计,目的在于比较处理组与对照组之间的基因表达差异。源站将其标注为 Expression Atlas experiment (Differential),主题标签为 Differential,说明该数据的核心用途是支撑差异表达层面的分析。
【数据内容】
数据内容为 RNA-seq 产生的转录组表达谱,覆盖人黑色素瘤细胞系 A375m2 在 SB202190 处理、BIRB796 处理以及 DMSO 对照条件下的表达信息。实验围绕药物扰动下的转录组变化展开,可用于识别处理组相对于对照组的差异表达基因。关于样本数量、测序深度、reads 长度、具体基因数目等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk,属于 Expression Atlas 中的差异表达实验条目。物种信息为 Homo sapiens,实验材料为人黑色素瘤细胞系 A375m2,处理条件包括 SB202190、BIRB796 以及 DMSO 对照,检测手段为 RNA-seq。关于具体的建库方法、测序平台、测序试剂与数据处理流程等实验细节,源站未提供。
【适用场景】
依据其差异表达实验的定位,该数据适用于以下方向:差异表达分析,即比较药物处理组与 DMSO 对照组之间的基因表达变化;药物响应机制探索,即围绕 SB202190 与 BIRB796 两种化合物在黑色素瘤细胞中的转录组响应开展研究;黑色素瘤相关转录调控研究,即利用该细胞系的表达谱探讨转录层面的调控特征。此外,该数据也可作为肿瘤/皮肤癌方向转录组研究的参考数据使用。
【使用方法】
该数据为 RNA-seq 差异表达实验数据,使用时可围绕处理组与对照组的比较开展差异表达分析,并结合药物扰动背景解释表达变化。关于数据的具体下载方式、文件格式、分析流程与参数设置,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 Expression Atlas 收录的差异表达实验,物种与细胞系信息明确,处理条件与对照设置清晰。需要说明的是,该数据基于单一细胞系 A375m2 的体外实验,关于样本重复数、测序质量指标、数据过滤标准等信息,源站未提供,使用时应结合源站条目进一步核实。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与许可条款,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-9273
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. RNA-seq of human melanoma cell line A375m2 treated with SB202190 OR BIRB796 against DMSO-treated controls
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