TCGA直肠腺癌数据集
TCGA-READ 包含直肠腺癌病例的基因组、转录组、临床及部分影像数据，适合分子分型和预后分析。由The Cancer Genome Atlas提供，来自The Cancer Imaging Archive，包含多种数据模态，适用于分类任务，许可证为CC BY 4.0，专注于肿瘤领域的直肠癌研究。
基本信息
模态
多模态
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2026-09-06
资源简介
TCGA-READ 包含直肠腺癌病例的基因组、转录组、临床及部分影像数据，适合分子分型和预后分析。
下载信息
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使用方式
数据集获取（TCIA 标准方式）
方式一：NBIA 搜索
- 打开 NBIA 搜索页（免费注册 TCIA 账号）；
- 按本数据集 Collection 名称筛选（见源站页面），加入 Download Basket；
- 用 NBIA Download Manager 批量下载 DICOM。
方式二：NBIA API（程序化）
curl -s "https://services.cancerimagingarchive.net/nbia-api/services/v1/getSeries?Collection=COLLECTION_NAME" -o series.json
方式三：TCIA Manifest + dicomsort
在 Collection 页面下载 .tcia manifest 文件后用 NBIA CLI 下载。
数据说明
TCGA-READ 包含直肠腺癌病例的基因组、转录组、临床及部分影像数据，适合分子分型和预后分析。
数据加载示例（DICOM 影像）
import pydicom, glob, os
files = glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.dcm"), recursive=True)
d = pydicom.dcmread(files[0])
print("Modality:", d.Modality)
img = d.pixel_array
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