直肠癌(MSK,Nature Medicine 2019):MSK-IMPACT靶向测序匹配的直肠癌肿瘤与肿瘤样样本数据集

该数据集提供了直肠癌肿瘤与匹配的肿瘤样样本的MSK-IMPACT靶向测序数据,包含临床表格数据(如突变计数、基因突变信息、TMB评分、MSI状态等)和拷贝数变异数据,主要用于直肠癌的基因组特征分析、肿瘤异质性研究以及基于分子特征的精准治疗策略探索,为癌症研究提供了重要的多模态生物信息学资源。

MSK Data Catalog
datacatalog.mskcc.org
直肠癌靶向测序
原始链接

https://datacatalog.mskcc.org/dataset/10393

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资源简介

该数据集包含基于FDA批准的MSK-IMPACT肿瘤分析面板进行大规模平行测序的直肠癌肿瘤样样本汇总数据可视化结果和临床数据。数据集内容涵盖突变计数、突变基因信息、基因面板、Impact TMB评分、来源机构、MSI评分与类型、样本覆盖度、体细胞状态、样本保存类型、衍生前的治疗方案与组织部位、肿瘤纯度等临床信息。同时提供可下载的拷贝数片段数据(.seg格式),可通过Integrative Genomics Viewer进行可视化分析。该数据集主要用于直肠癌的基因组学研究、肿瘤异质性分析以及精准医疗策略开发。

提供机构:MSK Data Catalog

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影像Rectal Cancer (MSK, Nature Medicine 2019): MSK-IMPACT targeted sequencing of matched rectal cancer tumor and tumoroid samples