前列腺癌进展:从非恶性到骨转移
主题标签:前列腺癌、肿瘤进展、骨转移、非恶性、蛋白质组学。本站分类:肿瘤/前列腺癌。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖前列腺癌。

基本信息
资源简介
前列腺癌进展:从非恶性到骨转移
Prostate cancer progression: From non-malignant to bone metastasis 是一个以前列腺癌进展为主题的公开发布数据集,来源为 EBI(ebi.ac.uk)所属的 PRIDE 归档平台,项目编号为 PXD009868,由 Diego Iglesias-Gato 于 2018 年发布。该数据集聚焦于前列腺癌从非恶性状态向骨转移阶段的演进过程,主题标签涵盖前列腺癌、肿瘤进展、骨转移、非恶性与蛋白质组学,在本站归入肿瘤/前列腺癌分类。作为肿瘤领域的公开数据集,它为研究者了解前列腺癌病程演变的分子层面信息提供了一个可检索、可引用的数据资源入口,适合与肿瘤生物学、泌尿系统肿瘤及转移机制相关的研究工作配合使用。
【数据集背景】
前列腺癌是肿瘤研究中的重要对象,其病程通常涉及从非恶性组织状态向恶性、再向远处转移(尤其是骨转移)逐步演进的过程。理解这一演进过程背后的分子变化,是肿瘤基础研究与临床转化研究共同关注的问题。该数据集正是围绕“从非恶性到骨转移”这一纵向进展主题组织发布的,发布者为 Diego Iglesias-Gato,发布年份为 2018 年,托管于 EBI 的 PRIDE 归档平台,项目标识为 PXD009868。数据集在本站被归入肿瘤/前列腺癌分类,主题标签包括前列腺癌、肿瘤进展、骨转移、非恶性与蛋白质组学,说明其内容定位与前列腺癌进展的蛋白质组学研究方向相关。
【数据内容】
依据源站描述与主题标签,该数据集的主题覆盖前列腺癌、肿瘤进展、骨转移、非恶性以及蛋白质组学。数据集名称本身即表明其内容围绕前列腺癌从非恶性状态到骨转移的进展链条展开。关于具体的样本数量、样本类型构成、分组方式、检测平台、蛋白或基因数量、数据文件格式与体积等细节,源站未提供,因此无法在本介绍中给出确切说明。使用者应以 PRIDE 项目页面 PXD009868 上实际列出的文件清单与元数据为准。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk,具体托管于 PRIDE 归档平台的项目 PXD009868,发布者为 Diego Iglesias-Gato,发布年份为 2018 年。源站给出的引用描述为:Diego Iglesias-Gato (2018). Prostate cancer progression: From non-malignant to bone metastasis [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD009868。关于样本采集地点、采集时间跨度、伦理审批信息、实验操作流程与仪器参数等,源站未提供。
【适用场景】
结合其主题标签与分类,该数据集可适用于前列腺癌进展相关的研究场景,例如探讨非恶性状态向肿瘤状态转变、以及肿瘤向骨转移演进过程中的蛋白质组学特征;也可用于肿瘤转移机制研究中的候选分子筛选、跨数据集比较分析,以及作为前列腺癌蛋白质组学研究的公开数据参考。由于数据集明确覆盖“非恶性”与“骨转移”两端,适合用于病程不同阶段之间的对照性分析思路。具体适用性仍需使用者结合源站提供的实际数据内容判断。
【使用方法】
使用者可通过源站给出的项目地址 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD009868 访问该数据集,并依据 PRIDE 平台提供的检索与下载方式获取数据。关于数据下载的具体格式、文件组织方式、配套分析流程与推荐工具,源站未提供,需以项目页面实际说明为准。建议在使用前先阅读项目页面的元数据与文件说明,确认样本分组与数据内容后再开展分析。
【质量与限制】
该数据集为公开归档数据集,其发布者、发布年份与来源平台信息明确。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应、样本量充分性以及技术验证结果等,源站未提供。使用者应注意,本介绍中未涉及的任何具体数值与结论均不应被视为该数据集的实际属性,实际使用时应以源站项目页面的原始信息为准。
【引用与许可】
引用该数据集时,建议采用源站给出的引用形式:Diego Iglesias-Gato (2018). Prostate cancer progression: From non-malignant to bone metastasis [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD009868。关于该数据集的具体许可条款与使用限制,源站未提供,使用者应查阅 PRIDE 项目页面获取相关信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD009868
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Diego Iglesias-Gato (2018). Prostate cancer progression: From non-malignant to bone metastasisProstate cancer progression: From non-malignant to bone metastasis [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD009868
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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