激素治疗初治局限性前列腺癌上皮功能状态与成纤维细胞表型图谱

该数据集为来自 cellxgene.cziscience.com 的单细胞数据集,收录 24 例激素治疗初治局限性前列腺癌样本,构建了单细胞图谱,并在三个粒度层级上进行注释

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基因组分类prostatic acinar adenocarcinoma
Profiling of epithelial functional states and fibroblast phenotypes in hormone therapy-naïve localised prostate cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

激素治疗初治局限性前列腺癌上皮功能状态与成纤维细胞表型图谱

该数据集为来自 cellxgene.cziscience.com 的单细胞数据集,收录 24 例激素治疗初治局限性前列腺癌样本,构建了单细胞图谱,并在三个粒度层级上进行注释。其英文名称为 Profiling of epithelial functional states and fibroblast phenotypes in hormone therapy-naïve localised prostate cancer,本站分类归入肿瘤 / 前列腺癌,主题标签为 prostatic acinar adenocarcinoma。源站描述指出,这是一个针对 24 例激素治疗初治局限性前列腺癌的单细胞图谱,疾病为前列腺腺泡腺癌,组织为前列腺,检测方法为 10x 3' v3,属于 CZ CELLxGENE 单细胞数据集。该数据集的核心价值在于以单细胞分辨率刻画激素治疗初治状态下局限性前列腺癌中上皮功能状态与成纤维细胞表型,并通过多层级注释支持后续分析与再利用。

【数据集背景】

前列腺癌是男性常见的恶性肿瘤之一,其中局限性前列腺癌在临床中占有相当比例。激素治疗初治状态下的肿瘤样本能够反映未受内分泌治疗干扰的生物学特征,对于理解肿瘤起始阶段或早期阶段的细胞组成具有重要意义。该数据集聚焦于激素治疗初治的局限性前列腺癌,旨在通过单细胞层面的图谱构建,刻画上皮细胞的功能状态以及成纤维细胞的表型。源站描述明确其疾病类型为前列腺腺泡腺癌,组织来源为前列腺,这为研究前列腺腺泡腺癌的细胞异质性提供了单细胞分辨率的数据基础。数据集在三个粒度层级上进行注释,意味着使用者可以从较粗的细胞大类到较细的细胞亚群逐步深入分析,从而更灵活地探索上皮与成纤维细胞群体的内部结构。

【数据内容】

该数据集收录了 24 例激素治疗初治局限性前列腺癌样本,并以单细胞图谱的形式呈现。源站描述指出,该图谱在三个粒度层级上进行注释,说明数据中包含了不同精细程度的细胞类型或状态标签。主题标签为 prostatic acinar adenocarcinoma,表明数据所涉及的疾病对象是前列腺腺泡腺癌。检测方法为 10x 3' v3,属于单细胞转录组测序技术的一种。数据集名称中特别提到上皮功能状态与成纤维细胞表型,说明该图谱重点关注这两类细胞群体。除此之外,关于具体的细胞数量、基因数量、注释层级的具体名称、细胞类型组成比例、测序深度、样本临床信息等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 cellxgene.cziscience.com,属于 CZ CELLxGENE 平台上的单细胞数据集。源站描述显示,其组织来源为前列腺 gland,疾病为 prostatic acinar adenocarcinoma,检测方法为 10x 3' v3。样本为 24 例激素治疗初治局限性前列腺癌。关于样本采集的具体地点、时间跨度、伦理审批信息、患者纳入排除标准、样本处理流程等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于前列腺癌单细胞层面的探索性研究,尤其是针对激素治疗初治局限性前列腺癌中上皮功能状态与成纤维细胞表型的分析。由于数据在三个粒度层级上进行了注释,使用者可以在不同分辨率下开展细胞类型鉴定、细胞状态比较、上皮与成纤维细胞群体的异质性分析等。主题标签 prostatic acinar adenocarcinoma 表明其可用于前列腺腺泡腺癌的相关研究。此外,作为 CZ CELLxGENE 上的单细胞数据集,它也可用于单细胞数据整合、注释方法评估或与其他前列腺癌单细胞数据集的比较研究。关于具体的分析工具兼容性、数据格式细节等,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 cellxgene.cziscience.com 获取。作为 CZ CELLxGENE 单细胞数据集,通常可在该平台上进行在线浏览、细胞类型注释查看以及数据下载。使用者可根据三个粒度层级的注释信息,选择合适的分辨率进行下游分析。关于下载文件的具体格式、是否需要注册、是否有使用限制、是否提供原始计数矩阵或仅提供处理后数据等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于 24 例激素治疗初治局限性前列腺癌样本构建,样本量在单细胞研究中属于中等规模,能够支持图谱级别的描述,但可能不足以覆盖前列腺腺泡腺癌的全部异质性。由于聚焦于激素治疗初治局限性前列腺癌,其结论不宜直接外推至去势抵抗性前列腺癌、转移性前列腺癌或其他治疗背景下的样本。检测方法为 10x 3' v3,属于特定平台与化学版本,可能带来相应的技术偏好。关于数据质量指标、批次效应、细胞过滤标准、双细胞去除情况、注释可信度评估等,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 cellxgene.cziscience.com,属于 CZ CELLxGENE 单细胞数据集。关于具体的引用文献、作者列表、发表期刊、DOI、数据许可协议、使用条款以及是否允许商业用途等,源站未提供。

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源站:https://cellxgene.cziscience.com/collections/bdac7a53-fe34-4f04-8c46-f9bd5297c099

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

A single-cell atlas of 24 hormone therapy naive localised prostate cancers, annotated at three levels of granularity. Diseases: prostatic acinar adenocarcinoma. Tissues: prostate gland. Assays: 10x 3’ v3. Single-cell dataset (CZ CELLxGENE).

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