基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

转移性去势抵抗性前列腺癌两种族患者循环游离DNA数据集

该数据集为来源于转移性去势抵抗性前列腺癌（mCRPC）患者血浆游离DNA（cfDNA）的跨种族比较研究数据，英文全称为“PRJNA1393153: Circulating cell-free DNA dataset extracted from metastatic castration-resistant prostate cancer patients across two races, African American men and Caucasian men”。研究采用横断面比较队列分析设计，旨在识别非洲裔美国男性（AAM）与白人男性（CM）之间cfDNA变异图谱的祖源相关差异。经数据整理，最终纳入88份血浆样本，其中白人男性66份、非洲裔美国男性22份；另有1份样本因测序质量不达标被排除，2份样本因缺乏种族信息被排除。该数据集在站内归类于肿瘤／前列腺癌方向，主题标签为原始测序读段（Raw sequence reads），来源站为ncbi.nlm.nih.gov。

【数据集背景】

前列腺癌是男性常见的恶性肿瘤之一，而转移性去势抵抗性前列腺癌（mCRPC）是该疾病进展至晚期、对雄激素剥夺治疗产生抵抗后的阶段，临床治疗难度大、预后差异显著。不同祖源人群之间在前列腺癌的发病率、疾病进展速度及治疗反应上可能存在差异，因此从分子层面探索与祖源相关的变异特征具有研究价值。循环游离DNA（cfDNA）来源于血浆，能够在一定程度上反映肿瘤的基因组信息，且获取方式相对微创，已成为液体活检研究的重要材料。该数据集正是围绕mCRPC患者血浆cfDNA展开，通过比较非洲裔美国男性与白人男性两类人群，尝试揭示cfDNA变异图谱中可能存在的祖源相关差异，为后续理解不同人群前列腺癌分子特征差异提供数据基础。

【数据内容】

该数据集的核心内容为血浆游离DNA相关的原始测序读段，主题标签明确指向“Raw sequence reads”。研究最终整理纳入88份血浆样本，其中66份来自白人男性（CM），22份来自非洲裔美国男性（AAM）。在样本筛选过程中，有1份样本因测序质量不足而被排除，另有2份样本因缺少种族信息而被排除。数据集整体属于横断面、比较队列分析性质，关注的是cfDNA变异图谱在两类祖源人群之间的差异。除上述样本数量、分组及测序读段类型外，源站未提供更详细的变异位点、基因列表、测序平台或覆盖深度等信息。

【采集与来源】

该数据集的样本来源为转移性去势抵抗性前列腺癌（mCRPC）患者的血浆，并从中提取游离DNA（cfDNA）。研究涉及的两类人群分别为非洲裔美国男性（AAM）与白人男性（CM）。数据来源站为ncbi.nlm.nih.gov。关于样本采集的具体时间范围、采集地点、机构伦理审批信息、患者入组标准及临床背景资料，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于围绕mCRPC血浆cfDNA展开的探索性研究，尤其是关注不同祖源人群之间cfDNA变异图谱差异的比较分析。由于数据包含原始测序读段，可用于重新分析、变异识别流程验证或与其它cfDNA数据集进行对照研究。其横断面比较队列设计也适合用于提出假设，而非直接推断因果关系。此外，该数据集可服务于前列腺癌液体活检方法学、肿瘤分子流行病学以及祖源相关差异研究等方向。具体适用场景需结合源站提供的原始数据与分析文档进一步确认，源站未提供更明确的推荐用途。

【使用方法】

该数据集以原始测序读段形式提供，通常需要经过质量控制、比对、变异识别等生物信息学流程后方可用于下游分析。使用者可根据研究目的，将66份白人男性样本与22份非洲裔美国男性样本进行分组比较，以探索cfDNA变异图谱的祖源相关差异。由于数据来源于血浆cfDNA，分析时需考虑cfDNA片段化、肿瘤含量较低等常见技术特点。关于具体的下载方式、数据格式、参考基因组版本及推荐分析流程，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集在整理过程中已进行样本筛选：1份样本因测序质量不足被排除，2份样本因缺少种族信息被排除，最终纳入88份样本。这一筛选过程有助于保证纳入样本在测序质量和种族信息完整性方面满足分析要求。然而，该研究为横断面比较队列分析，样本量在两组间并不均衡，白人男性66份、非洲裔美国男性22份，可能影响统计比较的效能。此外，源站未提供关于测序深度、覆盖均一性、批次效应、临床分期及治疗史等可能影响结果解释的信息。因此，使用该数据集时应注意其观察性、比较性研究的固有局限，不宜直接用于因果推断或临床决策。

【引用与许可】

该数据集的来源站为ncbi.nlm.nih.gov，英文名称为“PRJNA1393153: Circulating cell-free DNA dataset extracted from metastatic castration-resistant prostate cancer patients across two races, African American men and Caucasian men”。关于具体的引用格式、作者列表、发表文献、数据许可条款及使用限制，源站未提供。使用者在下载、分析及发表相关成果前，应自行查阅源站页面以确认最新的引用要求和许可条件。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1393153

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1393153

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究是一项横断面、比较性队列分析，针对转移性去势抵抗性前列腺癌（mCRPC）男性的血浆游离DNA（cfDNA），旨在识别非裔美国男性（AAM）与白人男性（CM）之间cfDNA变异图谱中与祖先相关的差异。在排除1份测序质量不合格的样本和2份缺乏种族信息的样本后，最终整理的数据集包括88份血浆样本（66份CM，22份AAM）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别