腹膜后淋巴结微转移来源的转移性前列腺癌类器官

该数据集为从腹膜后淋巴结微转移灶获取的转移性前列腺癌类器官的原始测序数据,属于肿瘤/前列腺癌分类,来源为NCBI。源站描述指出前列腺癌治疗受限于缺乏临床相关疾病模型,公开的4000多个癌细胞系中仅三个表达雄激素受体,而类器官培养系统有助于实现个体化治疗选择

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基因组分类Raw sequence reads
PRJNA1255230: Metastatic prostate cancer organoids obtained from micro-metastasis at a retroperitoneal lymph node

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

腹膜后淋巴结微转移来源的转移性前列腺癌类器官

PRJNA1255230 是一个聚焦转移性前列腺癌的类器官研究数据集,其样本取自腹膜后淋巴结的微转移灶,并以原始测序读段(Raw sequence reads)的形式组织发布,来源为 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),在本站归入肿瘤/前列腺癌分类。该数据集所对应的研究背景强调,前列腺癌治疗长期受制于缺乏临床相关的疾病模型:在公开可获取的 4000 多个癌细胞系中,仅三个表达雄激素受体,难以代表这种高度异质性疾病的真实面貌;而类器官培养体系为个体化治疗选择提供了可行途径。围绕这一背景,该数据集以从腹膜后淋巴结微转移部位建立的转移性前列腺癌类器官为对象,提供其原始测序数据,供后续分析与再利用。

【数据集背景】

前列腺癌是一种异质性显著的肿瘤,其治疗研究长期受限于缺乏能够反映临床实际的疾病模型。公开可用的癌细胞系数量虽已超过 4000 个,但其中仅三个表达雄激素受体,这一数量与疾病本身的复杂性明显不匹配,因而难以支撑对治疗反应的可靠预测。类器官培养系统的出现为弥补这一缺口提供了新思路,使个体化治疗方案的探索成为可能。该数据集正是在这一需求下产生,其样本来自腹膜后淋巴结的微转移灶,并由此建立转移性前列腺癌类器官,为在更贴近临床的模型上开展研究提供了数据基础。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Raw sequence reads,即原始测序读段,属于测序产生的第一手数据,而非经过汇总或注释的加工结果。数据所对应的生物学材料为从腹膜后淋巴结微转移灶获取的转移性前列腺癌类器官。除上述内容外,关于测序平台、读段长度、样本数量、数据体积、文件格式等具体技术参数,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。样本的采集部位为腹膜后淋巴结的微转移灶,属于转移性前列腺癌的取材场景,并在此基础上建立类器官培养物。关于供者信息、采集时间、伦理审批与样本处理流程等细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其原始测序读段的属性与类器官模型的来源,该数据可用于围绕转移性前列腺癌类器官开展的测序数据分析,例如对类器官基因组特征的考察,以及在类器官体系下探索个体化治疗选择相关的研究方向。源站描述特别指出类器官培养系统有助于实现治疗方案的个体化,因此该数据也适合作为此类研究的数据支撑。关于具体的分析类型与已验证的应用案例,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以原始测序读段形式提供,使用者需按常规测序数据处理流程进行质控、比对与后续分析。关于参考基因组版本、推荐分析流程、配套元数据文件及访问下载的具体方式,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为原始测序读段,未提供经过加工或注释的结果数据。其模型来源于单一位点的微转移灶类器官,关于样本量、重复设置、测序深度与数据质量评估指标,源站未提供。使用者应注意原始读段需自行完成质控与处理后方可用于下游分析。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、文献出处与使用许可条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1255230

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

前列腺癌的治疗因缺乏临床相关的疾病模型而受到阻碍。在超过4000种公开可用的癌细胞系中,仅有三种表达雄激素受体的细胞系可作为这种异质性疾病的模型。类器官培养系统使我们能够个性化治疗选择。

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