PRJDB18027:前列腺癌VMAT急性不良事件尿液代谢物预测研究
容积旋转调强放疗(VMAT)是局限性前列腺癌患者的一种放疗技术,患者常经历急性不良事件,可能影响后续治疗。若能提前预测该情况,即可为个体患者调整放疗剂量

基本信息
资源简介
PRJDB18027:前列腺癌VMAT急性不良事件尿液代谢物预测研究
PRJDB18027 数据集围绕前列腺癌患者接受容积旋转调强放疗(VMAT)后出现的急性不良事件展开,尝试从尿液代谢物中寻找可提前预测这类事件的分子线索。VMAT 是局限性前列腺癌的一种放疗技术,患者常会经历急性不良事件,并可能因此影响后续治疗;如果能够在治疗前预判风险,就有望为个体患者调整放疗剂量。该数据集来源于 ebi.ac.uk,归类于肿瘤 / 前列腺癌方向,记录了以治疗性高剂量率辐射为背景、基于易采集的非侵入性尿液生物样本开展代谢组学分析的研究内容,属于回顾性分析性质的数据资源。
【数据集背景】
容积旋转调强放疗(VMAT)是局限性前列腺癌患者的一种放疗技术。临床实践中,接受该治疗的患者常经历急性不良事件,这些事件可能影响后续治疗进程。研究的基本设想是:如果能够提前预测急性不良事件的发生情况,就可以据此为个体患者调整放疗剂量,使治疗安排更具针对性。基于这一背景,该研究以回顾性分析的方式,尝试利用治疗性高剂量率辐射条件下采集的尿液代谢组学分子来预测急性不良事件。选择尿液的原因在于其作为非侵入性生物样本易于采集,适合作为常规监测或预测的样本来源。
【数据内容】
该数据集对应的研究纳入了 11 例接受 VMAT 治疗的前列腺癌患者,治疗方案为 76 Gy/38 分次,并采集了患者的尿液样本。观察结果显示,7 例患者(约 64%)出现泌尿生殖系统毒性(1 级),4 例患者未出现不良事件。研究使用质谱仪(QTRAP6500+,AB SCIEX)对尿液中的 630 种代谢物进行了分析。源站描述在代谢物分析结果处中断,未提供完整的分析结论或标志物列表。
【采集与来源】
数据来源于 ebi.ac.uk。样本为接受 VMAT(76 Gy/38 分次)治疗的前列腺癌患者尿液,属于非侵入性生物样本。代谢物检测采用质谱仪(QTRAP6500+,AB SCIEX)完成,共分析 630 种尿液代谢物。研究设计为回顾性分析。其余关于采集时间点、样本处理流程、伦理审批及数据提交机构等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与前列腺癌放疗相关的转化研究和临床辅助分析场景,例如探索尿液代谢物与 VMAT 治疗后急性不良事件之间的关联,评估以非侵入性尿液样本预测泌尿生殖系统毒性的可行性,以及为个体化放疗剂量调整提供研究依据。其回顾性研究性质使其更适合作为假设生成和后续验证研究的基础,而非直接用于临床决策。
【使用方法】
源站未提供具体的数据访问方式、文件格式、字段说明或分析流程。使用者需依据来源站 ebi.ac.uk 的公开信息自行确认获取途径与使用条件。
【质量与限制】
该研究样本量较小,仅纳入 11 例患者,其中 7 例出现 1 级泌尿生殖系统毒性、4 例未出现不良事件,分组规模有限。研究为回顾性分析,源站描述在代谢物分析结果处中断,未给出完整的预测分子结论。因此,基于该数据集得出的任何关联性认识都应谨慎对待,需在更大样本和前瞻性设计中进一步验证。其他质量控制信息源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供引用格式与许可条款信息。使用时应遵循来源站 ebi.ac.uk 的相关规定,并建议查阅该数据集对应的原始研究出版物以获取正式引用信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJDB18027
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
容积旋转调强放疗(VMAT)是局限性前列腺癌患者的一种放疗技术,患者常出现急性不良事件,可能影响后续治疗。若能提前预测这种情况,便可为每位患者量身调整放射剂量。本研究尝试通过回顾性分析,基于尿液代谢组学分子——此类分子作为非侵入性生物样本易于采集——来预测治疗所致高剂量率放射的急性不良事件。收集了11例接受VMAT治疗(76 Gy/38次)的前列腺癌患者的尿液。结果观察到7例患者(约64%)出现泌尿生殖系统毒性(1级),4例患者未出现不良事件。随后,使用质谱仪(QTRAP6500+,AB SCIEX)分析了630种尿液代谢物,并利用MetaboINDICATOR工具从代谢物的绝对定量值中提取出其中234种相关分子,作为生物学和临床应用指标。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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