基于空间多组学预测mHSPC中ADT联合二代新型内分泌药物疗效的前瞻性研究
标本将分为三部分:一份用于标准组织病理学,一份用于WES,一份用于空间多组学分析(Xenium和PhenoCycler-Fusion)

基本信息
资源简介
基于空间多组学预测mHSPC中ADT联合二代新型内分泌药物疗效的前瞻性研究
该数据集来源于clinicaltrials.gov,主题为转移性激素敏感性前列腺癌(Metastatic Hormone-Sensitive Prostate Cancer),英文全称为“A Prospective Study Based on Spatial Multi-omics to Predict the Efficacy of ADT Combined With Second-generation Novel Hormonal Agents in Metastatic Hormone-sensitive Prostate Cancer.”。研究聚焦于通过空间多组学手段预测ADT联合第二代新型激素药物治疗转移性激素敏感性前列腺癌的疗效。数据集所属分类为肿瘤/前列腺癌,核心方法涉及对入组患者的前列腺活检肿瘤组织进行三分法处理,分别用于标准组织病理学、全外显子组测序(WES)以及空间多组学分析(Xenium和PhenoCycler-Fusion)。研究还包含治疗期间的定期随访评估,以及以构建预后模型为主要目标的分析框架。
【数据集背景】
该数据集所对应的研究针对转移性激素敏感性前列腺癌患者,探索ADT联合第二代新型激素药物治疗的疗效预测。研究采用前瞻性设计,依托空间多组学技术,试图从肿瘤组织的空间分子特征中提取与治疗反应相关的信息。源站描述中明确列出了研究条件为转移性激素敏感性前列腺癌,并给出了主要目标与次要目标,为理解该数据集的研究定位提供了基础。
【数据内容】
数据集涉及的数据类型包括:标准组织病理学数据、全外显子组测序(WES)数据以及空间多组学分析数据(Xenium和PhenoCycler-Fusion)。标本采集自入组患者的前列腺活检肿瘤组织,并分为三部分:一份用于标准组织病理学,一份用于WES,一份用于空间多组学分析。随访数据方面,患者每3个月接受一次评估,包括全血细胞计数(CBC)、生化、性激素和血清PSA检测;前列腺mpMRI每3个月重复一次;若发生PSA进展,PSA检测频率可能调整。随访持续至去势抵抗性前列腺癌(CRPC)发生或死亡。主要目标为构建整合Xenium、WES和PCF数据的预后模型;次要目标包括bPFS和OS;进展定义为既往不可检测水平后PSA升高至≥0.2 ng/mL并在重复检测中确认。
【采集与来源】
数据采集来源为clinicaltrials.gov所描述的前瞻性研究。肿瘤组织通过前列腺活检从入组患者中采集。标本处理采用三分法,分别用于标准组织病理学、WES和空间多组学分析。随访评估每3个月进行一次,涵盖CBC、生化、性激素、血清PSA以及前列腺mpMRI。随访持续至CRPC发展或死亡。源站未提供具体的样本量、采集时间窗口、中心数量等细节。
【适用场景】
该数据集适用于转移性激素敏感性前列腺癌的治疗疗效预测研究,尤其是基于空间多组学整合分析的预后模型构建。潜在应用包括:利用Xenium、WES和PCF数据探索与ADT联合第二代新型激素药物治疗反应相关的生物标志物;分析bPFS和OS等结局指标;研究PSA进展模式。此外,标准组织病理学数据可用于常规病理评估的对照或补充。
【使用方法】
源站未提供具体的数据使用说明、访问方式或分析流程。仅从研究设计可知,主要分析目标为构建整合Xenium、WES和PCF数据的预后模型,次要分析涉及bPFS和OS。进展判定依据PSA升高至≥0.2 ng/mL并在重复检测中确认。随访数据按每3个月的时间间隔采集,PSA检测频率在PSA进展时可能调整。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量、样本量、缺失值处理、偏倚控制或验证策略的具体信息。已知限制可能包括:随访依赖定期评估,PSA进展定义有明确阈值,但源站未说明其他潜在局限。此外,源站未提供数据完整性、可重复性或外部验证的相关描述。
【引用与许可】
源站未提供引用格式、许可条款或数据共享政策。该数据集来源于clinicaltrials.gov,但源站描述中未包含使用许可或引用要求的具体说明。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT07795177
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
条件:转移性激素敏感性前列腺癌。1、基线样本采集:将通过前列腺活检从入组患者中采集肿瘤组织。标本将分为三部分:一份用于标准组织病理学检查,一份用于WES,一份用于空间多组学分析(Xenium和PhenoCycler-Fusion)。2、随访:患者在治疗期间每3个月评估一次,包括全血细胞计数、生化、性激素和血清PSA。每3个月重复前列腺mpMRI。如果发生PSA进展,PSA检测频率可调整。随访持续至CRPC发生或死亡。3、(1)主要:构建整合Xenium、WES和PCF数据的预后模型。(2)次要:bPFS和OS。(3)进展:在先前检测不到的水平之后,PSA升高至≥0.2 ng/mL并在重复检测中确认。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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