CHIMERA前列腺癌生化复发预测数据集

CHIMERA Task 1 面向前列腺癌生化复发预测,包含组织病理、MRI及临床表格等多模态数据。由CHIMERA Challenge提供,来自Grand Challenge,包含95条数据记录,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的前列腺癌复发研究。

CHIMERA ChallengeCHIMERA Challenge
Grand Challenge
2025-01-01 更新
浏览 12
多模态分类Prostate CancerBiochemical RecurrenceHistopathologyH&E-stained whole slide imagesmpMRIClinical DataMultimodal
CHIMERA Task 1 Prostate Cancer Biochemical Recurrence Prediction

基本信息

模态
多模态
数据量
95
任务类型
分类
创建/更新时间
2025-01-01

资源简介

CHIMERA前列腺癌生化复发预测数据集

【一句话概览】

该任务聚焦于前列腺癌患者生化复发(BCR)的预测,使用多模态数据,包括组织病理学(H&E染色全切片图像)、多参数MRI(mpMRI)和临床信息。参与者需开发模型,利用每位患者的完整切片和多模态数据预测患者层面的复发,以贴近真实世界前列腺切除术标本的复杂性。任务标签涉及前列腺癌、生化复发、组织病理学、H&E染色全切片图像、mpMRI、临床数据及多模态(来源 chimera.grand-challenge.org)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Task 1: Prostate Cancer Biochemical Recurrence Prediction》。

【数据内容】

源站原始描述:This task focuses on predicting biochemical recurrence (BCR) in prostate cancer patients using multimodal data, including histopathology (H&E-stained whole slide images), multiparametric MRI (mpMRI), and clinical information. Participants are tasked with developing models that predict patient-level recurrence using the complete set of slides and multimodal data per patient to closely mimic the complexity of real-world prostatectomy specimens

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):本任务聚焦于利用多模态数据预测前列腺癌患者的生化复发(BCR),这些数据包括组织病理学(H&E染色的全切片图像)、多参数MRI(mpMRI)及临床信息。参与者的任务是开发模型,利用每位患者的全套切片和多模态数据预测患者层面的复发,以紧密模拟真实世界前列腺切除标本的复杂性。

【主题与分类】

主题标签:Prostate Cancer、Biochemical Recurrence、Histopathology、H&E-stained whole slide images、mpMRI、Clinical Data、Multimodal。

【适用方向】

多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://chimera.grand-challenge.org/task-1-prostate-cancer-biochemical-recurrent-prediction/

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下载信息

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使用方式

数据集获取

源站:https://chimera.grand-challenge.org/task-1-prostate-cancer-biochemical-recurrent-prediction/

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

CHIMERA Task 1 面向前列腺癌生化复发预测,包含组织病理、MRI及临床表格等多模态数据。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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