NF1施旺细胞基因型细胞绘制数据集

肿瘤领域图像公开数据集,来源:figshare。

WayScienceWayScience
Figshare
2025-01-01 更新
浏览 42
图像分类bioimagingexpressinggfptagged
NF1 Schwann Cell Genotype Cell Painting Assay

基本信息

模态
图像
大小
0.000631026 GB
数据量
20680
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2025-01-01
版本
v1

资源简介

NF1施旺细胞基因型细胞绘制数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Live cell bioimaging of S. cerevisiae expressing GFP tagged hAQP1.》。源站首次发布:2013-02-19。

【数据内容】

源站原始描述:(A), phase contrast; (B), GFP fluorescence; (C), DAPI fluorescence; (D), FM4-64 fluorescence. All images were generated at 100 times magnification

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 631.03 KB。Figure_6.tif:image/tiff,631.03 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0056431.g006。

【主题与分类】

源站学科分类:Biotechnology、Biochemistry、Microbiology。主题标签:bioimaging、expressing、gfp、tagged。

【适用方向】

影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/figure/_Live_cell_bioimaging_of_S_cerevisiae_expressing_GFP_tagged_hAQP1_/161620

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Bomholt, Julie; Hélix-Nielsen, Claus; Scharff-Poulsen, Peter; Amstrup Pedersen, Per (2015). Live cell bioimaging of S. cerevisiae expressing GFP tagged hAQP1.. PLOS ONE. Figure

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-13,引用时请注意版本时效。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Figure_6.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/491102"

文件清单

  • Figure_6.tif(631.03 KB)

文件总体积 631.03 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

(A), phase contrast; (B), GFP fluorescence; ©, DAPI fluorescence; (D), FM4-64 fluorescence. All images were generated at 100 times magnification.

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0056431.g006(source: https://plos.figshare.com/articles/figure/_Live_cell_bioimaging_of_S_cerevisiae_expressing_GFP_tagged_hAQP1_/161620)。

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