低级别星形细胞瘤潜在致病变异相关基因数据集

主题标签:肿瘤、毛细胞型星形细胞瘤、转录谱、基因变异、星形细胞瘤。本站分类:肿瘤/毛细胞型星形细胞瘤。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤。

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基因组分类肿瘤毛细胞型星形细胞瘤转录谱基因变异星形细胞瘤
Genes with potentially damaging variants for low-grade astrocytoma.

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

低级别星形细胞瘤潜在致病变异相关基因数据集

该数据集英文名为 Genes with potentially damaging variants for low-grade astrocytoma,本站将其归类于肿瘤领域下的毛细胞型星形细胞瘤方向,来源站为 ebi.ac.uk。从主题构成看,数据集围绕肿瘤、毛细胞型星形细胞瘤、转录谱、基因变异与星形细胞瘤等关键词展开,属于肿瘤领域的公开数据集。其源站描述指向一项 2015 年发布的研究成果,题为 Transcriptional profiles of pilocytic astrocytoma,由 Aleksandra Pfeifer、Krzysztof Zakrzewski、Michał Jarząb、Małgorzata Oczko-Wojciechowska、Barbara Jarząb、Paweł Liberski 与 Magdalena Zakrzewska 共同完成,数据集页面位于 EBI ArrayExpress 平台,实验编号为 E-GEOD-73066。整体而言,该数据集面向低级别星形细胞瘤中可能具有损伤性变异的基因,并与毛细胞型星形细胞瘤的转录谱研究相关联,可供关注该肿瘤类型分子特征的研究者参考使用。

【数据集背景】

毛细胞型星形细胞瘤是星形细胞瘤中的一种类型,本站分类将其单独列为肿瘤领域下的一个方向。该数据集的主题标签同时涵盖肿瘤、毛细胞型星形细胞瘤、转录谱、基因变异与星形细胞瘤,说明其关注点落在这一肿瘤类型的基因层面变异与转录层面的整体表达特征上。数据集名称强调“可能具有损伤性变异的基因”,与源站描述中“毛细胞型星形细胞瘤转录谱”的研究主题相互呼应,共同构成该数据集的基本背景。源站未提供该研究的具体立项背景、科学假设与临床动机。

【数据内容】

依据数据集名称与主题标签,其内容涉及与低级别星形细胞瘤相关、可能带有损伤性变异的基因,以及毛细胞型星形细胞瘤的转录谱信息。本站分类为肿瘤 / 毛细胞型星形细胞瘤。除上述主题范围外,源站未提供关于样本数量、基因数目、检测平台、数据文件格式与字段结构的具体说明。

【采集与来源】

该数据集来源站为 ebi.ac.uk,页面位于 EBI ArrayExpress 平台,实验编号为 E-GEOD-73066。源站描述显示,该数据集由 Aleksandra Pfeifer、Krzysztof Zakrzewski、Michał Jarząb、Małgorzata Oczko-Wojciechowska、Barbara Jarząb、Paweł Liberski 与 Magdalena Zakrzewska 于 2015 年发布,标题为 Transcriptional profiles of pilocytic astrocytoma。源站未提供样本采集地点、采集时间、伦理审批与处理流程等更细的信息。

【适用场景】

该数据集可用于围绕毛细胞型星形细胞瘤的转录谱与基因变异开展探索性分析,例如考察与低级别星形细胞瘤相关、可能具有损伤性变异的基因在转录层面的表现,或作为该肿瘤类型分子特征研究的参考数据。其主题标签涵盖肿瘤与星形细胞瘤,也可用于相关肿瘤研究中的对照与比较背景。源站未提供具体的适用分析类型与应用案例。

【使用方法】

该数据集通过 EBI ArrayExpress 平台以实验编号 E-GEOD-73066 提供访问,使用者可依据该编号在源站定位数据集页面。源站未提供下载方式、文件组织、预处理步骤与分析流程等具体使用说明。

【质量与限制】

该数据集为 2015 年发布的公开数据集,来源站为 ebi.ac.uk,具备明确的实验编号与作者信息,便于溯源。其主题聚焦于毛细胞型星形细胞瘤的转录谱与相关基因变异,覆盖范围相对专一。源站未提供样本规模、数据完整性、质控指标与已知偏差等质量相关信息,使用时应结合源站页面自行核实。

【引用与许可】

引用该数据集时,可参考源站描述中的文献信息:Aleksandra Pfeifer、Krzysztof Zakrzewski、Michał Jarząb、Małgorzata Oczko-Wojciechowska、Barbara Jarząb、Paweł Liberski、Magdalena Zakrzewska(2015),Transcriptional profiles of pilocytic astrocytoma,数据集页面为 https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-73066。源站未提供该数据集的具体许可条款与使用限制。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-73066

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Aleksandra Pfeifer; Krzysztof Zakrzewski; MichaÅ? JarzÄ?b; MaÅ?gorzata Oczko-Wojciechowska; Barbara JarzÄ?b; PaweÅ? Liberski; Magdalena Zakrzewska (2015). Transcriptional profiles of pilocytic astrocytoma [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-73066

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